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Epidemiologic appraisal of single nucleotide polymorphisms & the relevance of epigenetic regulation in selected emphasis of the metabolic syndrome
Stefanie Doris Englert
Art der Arbeit
Diplomarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Alexander Haslberger
DOI
10.25365/thesis.11973
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29847.49011.588653-5
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Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Komplexe Krankheiten zeichnen sich durch das Zusammenwirken mehrerer genetischer und umweltbedingter Faktoren aus. In der Epigenetik werden Veränderungen des Chromatins untersucht, welche die DNA Sequenz nicht verändern jedoch auf Umweltfaktoren und Alterungsprozesse reagieren und somit die Genexpression beeinflussen.
Moderne epidemiologische Forschung versucht Möglichkeiten zu entwickeln um komplexe Gen-Umwelt Interaktionen zu verstehen. In der Vergangenheit konnten in Genom-weiten Studien einige bahnbrechende Erfolge erzielt werden. Trotzdem gab es bisher noch keine zufriedenstellenden Ansätze um ständig wiederkehrende Probleme zu lösen. Zu den Schwierigkeiten zählen die oft kleinen Effekte einzelner Polymorphismen, die heterogene Ätiologie einer komplexen Krankheit und zu kleine Studiengrößen um Effekte zu detektieren.
Eine vielversprechende Herangehensweise ist die gleichzeitige Untersuchung epigenetischer und genetischer Marker.
In dieser Arbeit wurde ein Netzwerk der adaptiven Thermogenese gewählt in dem das Zusammenspiel von Umwelt und Genetik klar ersichtlich ist. Die Ergebnisse einer systematischen Literatursuche sowohl nach Assoziationsstudien als auch nach Studien epigenetischer Modifikationen ergaben, dass Epigenetik eine nicht zu vernachlässigende Rolle spielt, wogegen die Studien an Polymorphismen keine klare Evidenz für deren Beteiligung an der Entstehung von Übergewicht lieferten.
Zukünftige Forschungsansätze in gewissenhaft geplanten Studien werden verschiedene Biomarker einsetzen müssen. Jedoch stellen auch hier die Studiengrößen weiterhin ein Problem dar. Den Erfordernissen eines modernen Public Health Sektors wird dies ebenfalls dienlich sein.
Des Weiteren haben validierte epigenetische Marker großes Potential zur Steigerung der Prognosesicherheit genetischer Tests.
Abstract
(Englisch)
A complex trait consists of the interplay of several networks, tissues, and environments. The Epigenome includes all mechanisms and marks that alter chromatin without changing the DNA sequence. It is tissue and cell-type specific and varies as a function of time, environmental factors, and random processes.
Human genome epidemiology offers frameworks for understanding joint impacts of genes and environments regarding disease risk. Genome-wide association studies have identified many genetic variations and provided insights into the genetic architecture of diseases. However, modest effect sizes of common mutations and inadequate power to overcome the heterogeneity of genetic
effects could not be revealed by stringent genome wide significance thresholds.
This work approached epigenetic influence on transcriptional regulation in a case study on adaptive thermogenesis and obesity on a network level. Results from a systematic literature search were compared to research findings from genome association studies on SNPs common in Caucasians. Whether these polymorphisms diminish energy expenditure remains unclear and has to be warranted in further studies. Altogether, the results of the analysis let suggest that hereditary genetic- and environment responsive regulation is involved.
Integration of epigenetic markers in epidemiologic research could thus help to unravel multi-gene-environment interactions in the development of obesity. Future research strategies that simultaneously study biomarkers of exposure, susceptibility, outcomes in appropriately planned, designed, and conducted
studies will extend beyond current approaches. Nevertheless, sample size requirements remain an inescapable challenge. The integration of epigenetic markers in genetic testing should increase their predictive value for complex diseases with public health importance. Effective organization is vital for
disseminating genetic tests to the health care system.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
genetic epidemiology molecular epidemiology Obesity SNP Epigenetic genetic testing public health genomics
Schlagwörter
(Deutsch)
genetische Epidemiologie molekulare Epidemiologie Übergewicht Obesitas SNP Epigenetik genetischer Test Public health
Autor*innen
Stefanie Doris Englert
Haupttitel (Englisch)
Epidemiologic appraisal of single nucleotide polymorphisms & the relevance of epigenetic regulation in selected emphasis of the metabolic syndrome
Paralleltitel (Deutsch)
Epidemiologische Begutachtung von Single Nucleotide Polymorphismen im Vergleich mit epigenetischen Regulationsmechanismen in einer Fallstudie des Metabolischen Syndroms
Publikationsjahr
2010
Umfangsangabe
VII, 108 Bl.
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Alexander Haslberger
Klassifikationen
30 Naturwissenschaften allgemein > 30.01 Geschichte der Naturwissenschaften ,
30 Naturwissenschaften allgemein > 30.02 Philosophie und Theorie der Naturwissenschaften ,
30 Naturwissenschaften allgemein > 30.30 Naturwissenschaften in Beziehung zu anderen Fachgebieten ,
44 Medizin > 44.14 Gesundheitsvorsorge ,
44 Medizin > 44.21 Ernährung ,
44 Medizin > 44.48 Medizinische Genetik ,
44 Medizin > 44.60 Medizinische Spezialfächer: Allgemeines ,
44 Medizin > 44.77 Stoffwechselkrankheiten
AC Nummer
AC08345004
Utheses ID
10799
Studienkennzahl
UA | 474 | | |