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Gel-Elektrophoretische Auftrennung von Proteinen bei Artemisia pancicii am Bisamberg (NÖ)
Yang Fan Qiu
Art der Arbeit
Diplomarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Wolfram Weckwerth
DOI
10.25365/thesis.14308
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29298.93908.315366-4
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Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Die vorliegende Arbeit hatte eine umfassende Charakterisierung der Proteinmuster von Artemisia pancicii am Standort Bisamberg zum Ziel. Um die Fragestellung zu beantworten, inwieweit das solitäre Pflanzenvorkommen am Westhang des Bisamberges eine einheitliche Formengruppe darstellt und damit zum Grundlagenwissen für das Verpflanzungsexperiment des „LIFE-Nature“ Projektes beizutragen, wurde eine Bestimmung des Proteinmusters mittels gelelektrophoretischem Verfahren durchgeführt.
Die Proteine wurden mittels ein-dimensionaler SDS-PAGE nach ihrem Molekulargewicht aufgetrennt. Die daraus resultierenden Ergebnisse zeigten trotz phänotypischer Differenzierungen, im elektrophoretischen Proteinmuster, bei zeitgleichen Versuchen, im Bandenmuster von Parallelproben und Vergleichsansätzen nur Unterschiede in der Intensität einiger Banden. Dies dürfte ein erster Hinweis auf einen einheitlichen Pflanzenverband von Artemisia pancicii am Westhang des Bisamberges sein. Des Weiteren wurde noch Pflanzenmaterial vom Untersuchungsstandort am Bisamberg im Glashaus des Departments für molekulare Systembiologie der Universität Wien, Althanstrasse und im Versuchsgarten des Botanischen Gartens der Universität Wien, Rennweg kultiviert und im Anschluss davon gezogene Proben aufgetrennt.
In allen Fällen zeigten die Proben sehr einheitliche Proteinmuster, zumindest in der niedrig auflösenden ein-dimensionalen SDS-PAGE. Standort und Umweltbedingung scheinen sich nur in der Intensität der Banden niederzuschlagen, im Bandenmuster selbst ist der Einfluss praktisch nicht zu erkennen.
Die Untersuchungen wurden durch weitere Versuche unter Einsatz einer hochauflösenden zwei-dimensionalen Gelelektrophorese ergänzt.
Im Hinblick auf den komplexen Gesamtstoffwechsel der Pflanzen, am Bisamberg im Gehölzsaum und offener Rasenfläche vorkommend, ergaben die Untersuchungen, nach der Auftrennung auf der ein-dimensionalen und zwei-dimensionalen Gelelektrophorese, soweit identifiziert, das Vorliegen eines einheitlichen Pflanzenverbands. Eine genauere Charakterisierung erfolgte im Anschluss, und auch als Ausblick auf weitere Untersuchungen, mittels gelfreier, auf Massenspektrometrie basierender „shotgun“-proteomics Methode.
Weitere zukünftige Studien sind erforderlich, um die beobachteten sehr interessanten phänotypischen Änderungen der Pflanze – z.B. dickeres Blattwachstum bei höheren Temperaturen und Luftfeuchtigkeit - als Anpassung an den jeweiligen Standort mit den genauen Änderungen der Proteinmuster zu korrelieren.
Abstract
(Englisch)
The following study represents the first proteomic characterisation of Artemisia pancicii on the Bisamberg. The question whether the solitary occuring plants on the Western slope of the Bisamberg form a homogenous group, which also gives us a basic insight into the transplantion experiment of the "LIFE - Nature" project, could be answered by making a profile of the protein patterns with the help of gel-electrophoretic methods.
The proteins were split by the means of one-dimensional SDS- Page according to their molecular weight. Phenotypical differences in the electrophoretic profiles of the protein patterns were mainly pronounced by the intensity of some bands. This conclusion was reached by the use of simultaneous experiments and comparisons of the band patterns of replicates.
The observations provide first hints for a homogeneous growth of Artemisia pancicii at the Bisamberg. Furthermore , samples of the plant material , which have been cultivated and retrieved from the Department of Molecular Systems Biology and the experimental garden of the Botanical garden of the Universit of Vienna, were analysed. In all cases the samples showed a uniform protein pattern, which could at least be shown in a low resolution one-dimensional SDS-PAGE.
The influence of local and environmental conditions only appeared in the intensity of the bands whereas it was hard to recognize it in the band patterns itself.
Proteomic analysis of A. pancii was further performed with the means of a high-resolution two-dimensional gel electrophoresis. Finally, a more thorough characterization followed, with the focus on further investigations by the means of a gel free "shotgun" proteomics method which bases on masspectrometry. With regard to the complex metabolism of the plants on the Bisamberg these investigations led to the initial conclusion that the plant-formations are uniform. However, these investigations need to be continued in the future with higher resolution and shotgun-proteomics methods.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
Artemisia pancicii Bisamberg proteomics gelelectrophoresis
Schlagwörter
(Deutsch)
Artemisia pancicii Bisamberg Proteinanalyse Gelelektrophorese
Autor*innen
Yang Fan Qiu
Haupttitel (Deutsch)
Gel-Elektrophoretische Auftrennung von Proteinen bei Artemisia pancicii am Bisamberg (NÖ)
Publikationsjahr
2011
Umfangsangabe
VIII, 60 S., [3] Bl.
Sprache
Deutsch
Beurteiler*in
Wolfram Weckwerth
Klassifikation
42 Biologie > 42.90 Ökologie: Allgemeines
AC Nummer
AC08549827
Utheses ID
12835
Studienkennzahl
UA | 444 | | |