Detailansicht
An evolutionary study on the role of the PEX11 gene family as a key player in peroxisome proliferation in A. thaliana
Kornelija Pranjic
Art der Arbeit
Dissertation
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Friedrich Kragler
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29496.25170.527963-5
Link zu u:search
(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Peroxisomen (PX) sind mobile Organellen, die in fast allen eukaryotischen Zellen vorkommen und von einer einfachen Membran umhüllt sind. In höheren Pflanzen sind PX in eine Vielzahl von physiologischen und biochemischen Stoffwechselfunktionen involviert, wie z.B. in der Photorespiration und der Biosynthese von Lipiden und Hormonen. Es sind 30 sogenannten Peroxine (PEX Proteine) bekannt, die eine wesentliche Rolle in der Biogenese von PX spielen. Innerhalb dieser Proteingruppe spielt vor allem die PEROXIN11 (PEX11) Protein Familie eine wesentliche Rolle in der Proliferation von PX.
In einer gemeinschaftlichen Studie wurde die Auswirkung von PEX11 Proteinen aus drei unterschiedlichen Organismen, Hefe (ScPEX11, ScPEX25 und ScPEX27), Mensch (PEX11α, β and γ) und Pflanzen (AtPEX11A bis-E), auf die Erscheinungsform und Anzahl der PX in Pflanzenzellen untersucht.
Meine Untersuchen haben gezeigt, dass alle PEX11 Proteine aus den drei verschiedenen Organismen gezielt an die peroxisomale Membran binden und die Überexpression der meisten PEX11 Proteine in unterschiedlichen Ausmaß einen Effekt auf die Anzahl und Erscheinungsform von PX hat. Diese Ergebnisse zeigen, dass die PEX11 Proteinfamilie einen hohen Konservierungsgrad bezüglich der Lokalisierung der PEX11 Proteine zwischen den unterschiedlichen Organismen aufweist, die einzelnen Proteine jedoch teilweise auch unterschiedliche Funktionen ausführen können.
Ein weiterer Aspekt meiner Arbeit war die Promotoranalyse von AtPEX11D, sowie die Suche nach möglichen Transkriptionsfaktoren, welche dessen Expression regulieren könnten.
Mit Hilfe von Deletionskonstrukten wurde ein essentieller Bereich im Promoter von AtPEX11D ermittelt, welcher für einen Hefe One-Hybrid Screen verwendet wurde. Für einen der dabei identifizierten Transkriptionsfaktoren konnte ein Einfluss auf die AtPEX11D Promoter abhängige Expression gezeigt werden.
Abstract
(Englisch)
Peroxisomes (PX) are highly dynamic organelles present in nearly all eukaryotic cells. In higher plants, PX are involved in a variety of essential physiological and biochemical processes such as photorespiration, lipid catabolism and biosynthesis of plant hormones. Over 30 proteins, the so-called peroxins, are known to be involved in PX biogenesis. Among these the PEROXIN 11 (PEX11) protein family members were identified as PX proliferation factors.
In a collaborative effort we studied the capacity of PEX11-protein family members of yeast (ScPEX11, ScPEX25 and ScPEX27), human (PEX11α, β and γ) and plant (AtPEX11-A to E) to induce peroxisomal proliferation in plants cells, by analysing the number and appearance of PX.
Our experiment showed that all PEX11 proteins, despite their origin are efficiently targeted to the peroxisomal membrane. The overexpression of the various PEX11 proteins affected the PX number and induced the formation of peroxisomal cluster to different degrees. This suggests that although the localisation to PX is conserved throughout the three kingdoms the individual PEX11 proteins may differ in some of their functions.
In a second approach we performed promoter studies on AtPEX11D and tried to identify a putative transcription factor regulating AtPEX11D expression.
Five different deletion constructs of the AtPEX11D promoter region were created and the expression was analyzed via a GUS reporter system in plants. We could identify a short promoter region sufficient to mediate expression, which was used in a yeast One-Hybrid system to screen for potential transcription factor(s) binding to the AtPEX11D promoter. So far, one identified transcription factor could be confirmed to alter AtPEX11D promoter driven expression in plant cells.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
PEX11 gene family peroxisomal proliferation A. thaliana promoter analysis SOL1
Schlagwörter
(Deutsch)
PEX11 Gen Familie peroxisomale Proliferation A. thaliana Promoteranalyse SOL1
Autor*innen
Kornelija Pranjic
Haupttitel (Englisch)
An evolutionary study on the role of the PEX11 gene family as a key player in peroxisome proliferation in A. thaliana
Paralleltitel (Deutsch)
Die Rolle der PEX11 Gen Familie als Schlüsselfaktor der peroxisomalen Proliferation in A. thaliana.
Publikationsjahr
2011
Umfangsangabe
155 S. : Ill., graph. Darst.
Sprache
Englisch
Beurteiler*innen
Kalervo Hiltunen ,
Eva Stöger
Klassifikation
30 Naturwissenschaften allgemein > 30.00 Naturwissenschaften allgemein: Allgemeines
AC Nummer
AC08966022
Utheses ID
14921
Studienkennzahl
UA | 091 | 438 | |