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Influence of dietary folate uptake on the metabolic profile and gene expression of the model organism Caenorhabditis elegans
Helen Fichtner
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Jürgen König
DOI
10.25365/thesis.17337
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29702.24787.888262-3
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Die vorliegende Masterarbeit besteht aus zwei voneinander unabhängigen Projekten, die sich beide mit dem Nematoden C. elegans beschäftigen. Der erste Teil dieser Arbeit hatte zunächst zur Aufgabe eine HPLC-MS Methode zu entwickeln mit der man Unterschiede in den metabolischen Profilen der Würmer zuverlässig und vor allem auch reproduzierbar messen kann. Dafür wurden gemischte, hungernde und nicht hungernde Wurmpopulationen verwendet die anschließend unter den gleichen Bedingungen analysiert wurden. Dadurch konnte gezeigt werden, dass der entwickelte HPLC Gradient durchaus in der Lage ist Unterschiede in den metabolischen Profilen aufzuzeigen. Zusätzlich zu der Reproduzierbarkeit der Messungen wurde der Einfluss der Lagerung auf das Ergebnis untersucht. Desweiteren konnte mit Hilfe der entwickelten Methode gezeigt werden, dass unterschiedliche Behandlungsarten, in diesem Fall eine Folsäuresupplementierung der Wurmpopulationen, zu anderen metabolischen Profilen führen als sie die jeweiligen Kontrollpopulationen zeigen. Abschließend wurden noch für die Zukunft interessante Forschungsansätze aufgezeigt mit deren Hilfe genauere Aussagen über die Veränderungen innerhalb der einzelnen metabolischen Profile möglich sind.
Das zweite Projekt innerhalb dieser Arbeit untersuchte die Auswirkungen einer Folsäuredefizienz auf die Genexpression von fünf aus dem Folsäurestoffwechsel ausgesuchten Genen: folt-1, Y4C6B.5, dhfr-1, mthf-1 und metr-1. Die Expressionsstudien wurden neben unterschiedlich gefütterten Wildtyp Nematoden zusätzlich noch an einem zweiten, Methioninsynthase-defizienten Stamm durchgeführt. Innerhalb von diesem Projekt wurde ebenfalls untersucht, ob die durch das Defizit ausgelösten Veränderungen durch die Gabe einer Folsäuresupplementierung wieder ausgeglichen werden können. Dabei konnte zum einen gezeigt werden, dass nicht nur der Nematodenstamm sowie die Futterwahl, sondern auch die Folsäuresupplementierung zu einer veränderten Expression der analysierten Gene führt. Im Diskussionsteil dieser Arbeit konnten schließlich sowohl Parallelen zu bereits bekannten Ergebnissen in der Literatur aufgezeigt werden als auch neue Erkenntnisse über dieses, bisher doch noch recht schlecht untersuchte Thema dargestellt werden
Abstract
(Englisch)
The presented master thesis contains two different projects, which both deal with the nematode C. elegans. The aim of the first part of this work was to develop a HPLC-MS method, which was able to show reliably and reproducibly the differences in the metabolic profiles of nematodes. Therefore, a mixed population of starved and non-starved nematodes was analyzed under the same conditions. With that, it could be shown that the developed HPLC gradient is able to match the requested demand. Additionally to the reproducibility of the measurements, the gradient was used to reveal that storage leads to alterations within the metabolic profiles. Furthermore, when compared to the control population it could be shown that different treatments of the worm population- in this case a supplementation with folic acid - is the reason for alterations in the metabolic profiles. In the end, research approaches for further investigation were shown, which might be able to explain and support the statements made in this thesis.
The second project within this work investigated the impact of a folic acid deficiency onto the expression of five genes, which were selected out of the folic acid metabolism: folt-1, Y4C6B.5, dhfr-1, mthf-1 und metr-1. Beside the investigation of differently fed wild type worms, RB755 nematodes, a second, methionine synthase deficient strain, was analyzed. Within this project it was also investigated whether the effect of the induced deficiency could be rescued by a folic acid supplementation. It could be shown that not only the selection of the strain as well as the choice of the food source have an impact on gene expression, but also the supplementation with folic acid leads to different data when compared to control worms. Within the discussion, it was possible to draw similarities of the current literature and the results of this work. Furthermore, new insights into this quite uninvestigated research area could be given.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
metabolic profile gene expression C. elegans Folsäure
Schlagwörter
(Deutsch)
metabolisches Profil Genexpression C. elegans folic acid
Autor*innen
Helen Fichtner
Haupttitel (Englisch)
Influence of dietary folate uptake on the metabolic profile and gene expression of the model organism Caenorhabditis elegans
Paralleltitel (Deutsch)
Einfluss der ditätetischen Folataufnahme auf das metabolische Profil und die Genexpression des Modellorganismus Caenorhabditis elegans
Publikationsjahr
2011
Umfangsangabe
117 S. : Ill., graph. Darst.
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Jürgen König
Klassifikation
30 Naturwissenschaften allgemein > 30.00 Naturwissenschaften allgemein: Allgemeines
AC Nummer
AC08902142
Utheses ID
15537
Studienkennzahl
UA | 066 | 838 | |