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Diversität und Verteilung sulfatreduzierender Prokaryoten in marinen Sedimenten
Ivan Barisic
Art der Arbeit
Diplomarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Michael Wagner
DOI
10.25365/thesis.2323
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-30491.44776.948162-6
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Die dissimilatorische Sulfatreduktion ist eine der wichtigsten biologisch durchgeführten
Stoffwechselreaktionen auf der Erde. Dies liegt unter anderem daran, dass bis zu 50%
des organischen Kohlenstoffs in marinen Sedimenten im Rahmen der an die
Sulfatreduktion gekoppelten Redoxreaktionen remineralisiert werden. 71% der
Planetenoberfläche sind von Meerwasser bedeckt. Im Rahmen dieser Arbeit sollte die
Diversität der dsrAB-Gene im marinen Sediment an der Küste Spitzbergens durch die
Erstellung einer dsrAB-Genbank untersucht werden. So konnten neben SRP von denen
bekannt ist, dass sie in marinen Sedimenten zu finden sind, neue Entwicklungslinien
gefunden werden, denen bislang keine kultivierten SRP zuordenbar sind. Diese neuen
Entwicklungslinien aber auch Proteobakterien dürften eine wichtige Rolle im Sediment
bei Station J spielen. Mit dem SRP-PhyloChip konnten ebenfalls Hinweise auf das
Vorhandensein von Vertretern der Desulfovibrionaceae, Desulfobacteraceae und
Desulfobulbaceae in den Sedimenten, die alle in die Klasse der Deltaproteobakterien
fallen, gesammelt werden.
Mit Real-Time-PCR wurde die Abundanz einer OTU (OTU 12), die in diese neue
Entwicklungslinie fällt und mit den meisten Klonen in der dsrAB-Genbank vertreten
war, gemessen. Mit einer relativen Häufigkeit von bis zu 2% ist OTU 12 in dem
untersuchten Habitat zahlenmäßig außergewöhnlich dominant. Auffällig ist, dass bei der
Tiefe von sieben Zentimetern bei der die höchsten Sulfatreduktionsraten gemessen
wurden, die Abundanz von OTU 12 abnimmt, während die Abundanz bei den Tiefen
von fünf, sechs und neun Zentimetern am höchsten ist.
Zusätzlich wurden alle bis zum November 2006 publizierten dsrAB-Genbanken von
marinen Sedimenten statistischen Analysen unterzogen. Vierzehn OTUs sind nur in
marinen Habitaten zu finden sind. Die Daten suggerieren, dass Desulfobacteraceae und
die neue, tiefzweigende Entwicklungslinie in allen kalten, marinen Sedimenten
vorhanden sind. Weiters wurden statistische Tests durchgeführt, die zeigten, dass sich
die publizierten dsrAB-Genbanken in ihrer Zusammensetzung stark voneinander
unterscheiden. Aufgrund der geringen vorhanden Datenmenge bleibt unklar ob die
Unterschiede durch biogeographische oder experimentelle Faktoren verursacht wurden.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
sulfatreduzierende Prokaryoten DSRab
Autor*innen
Ivan Barisic
Haupttitel (Deutsch)
Diversität und Verteilung sulfatreduzierender Prokaryoten in marinen Sedimenten
Publikationsjahr
2008
Umfangsangabe
115 S. : graph. Darst.
Sprache
Deutsch
Beurteiler*in
Michael Wagner
Klassifikation
42 Biologie > 42.13 Molekularbiologie
AC Nummer
AC07147038
Utheses ID
1971
Studienkennzahl
UA | 490 | | |
