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Community composition of microbial biofilm and suspended stream water communities during biofilm succession
Kristin Rath
Art der Arbeit
Diplomarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Tom Battin
DOI
10.25365/thesis.23228
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-30154.39053.129065-3
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Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Mikrobielle Biofilme in Fließgewässern entstehen durch die Anhaftung und das anschließende Wachstum von Zellen, die in der Wassersäule transportiert werden. In dieser Studie verglich ich die Zusammensetzung der mikrobiellen Gemeinschaft von Biofilm, der auf neuem Substrat wächst, mit jener der im Bachwasser suspendierten Gemeinschaft während der Anfangsstadien der Biofilmsukzession, um Informationen darüber zu gewinnen, wie die Biofilmgemeinschaft von der suspendierten Gemeinschaft während der Biofilmentwicklung geformt wird. Die dafür verwendete Methode war Terminal Restriction Length Polymorphism des 16S ribosmalen RNA-Gens. Die OTU-Richness und die Diversität waren in der suspendierten Gemeinschaft höher als in der Biofilmgemeinschaft. Im Verlauf der Sukzession nahmen die Richness und die Diversität der Biofilmgemeinschaft anfänglich zu, aber nach einigen Tagen nahm die Richness wieder leicht ab, während die Diversität stagnierte. Zu Beginn wiesen die Rang-Abundanz-Kurven der Biofilmgemeinschaft eine starke Steigung auf, die später allmählich abnahm. Die Zusammensetzung der mikrobiellen Gemeinschaft des Biofilms unterschied sich beträchtlich von der Zusammensetzung der suspendierten Gemeinschaft. Die Zusammensetzung der Biofilmgemeinschaft änderte sich im Laufe der Sukzession. Zeitliche Änderungen der im Bachwasser suspendierten Gemeinschaft zeigten keinen signifikanten Einfluss auf die Entwicklung der Biofilmgemeinschaft. Meine Ergebnisse legen den Schluss nahe, dass die Gemeinschaftsstruktur des Biofilms von einer Kombination aus Umweltfaktoren durch Species Sorting und autogene Sukzessionsprozesse innerhalb des Biofilms geformt wird.
Abstract
(Englisch)
Microbial biofilms in streams are formed by the attachment and subsequent growth of cells transported by the water column. In this study I compared the microbial community composition of stream biofilm growing on new substrate with its source community suspended in the stream water during the initial stages of biofilm succession using terminal restriction fragment length polymorphism of the 16S ribosomal RNA gene. The aim was to gain insight into how the biofilm community is shaped by the suspended source community during biofilm development. OTU richness and diversity were higher in the suspended than in the biofilm community. During succession richness and diversity of the biofilm community increased initially, but after a certain number of days richness decreased slightly again, whereas diversity stagnated. In the beginning the rank-abundance curves of the biofilm community showed a steep slope, which declined gradually later on. The microbial community composition of the biofilm differed considerably from the composition of the suspended community. The biofilm community composition changed during succession. Temporal variations of the source community suspended in the stream water showed no significant impact on biofilm community development. My findings indicate that stream biofilm community structure is shaped by a combination of environmental conditions through species sorting and autogenic successional processes within the biofilm.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
T-RFLP biofilm limnology microbial ecolgoy
Schlagwörter
(Deutsch)
T-RFLP Biofilm Limnologie mikrobielle Ökologie
Autor*innen
Kristin Rath
Haupttitel (Englisch)
Community composition of microbial biofilm and suspended stream water communities during biofilm succession
Paralleltitel (Deutsch)
Zusammensetzung von mikrobiellen Biofilm- und suspendierten Bachwassergemeinschaften während der Biofilmsukzession
Publikationsjahr
2012
Umfangsangabe
34 S. : Ill., graf. Darst.
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Tom Battin
Klassifikation
42 Biologie > 42.93 Limnologie
AC Nummer
AC10500006
Utheses ID
20776
Studienkennzahl
UA | 444 | | |