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Impact of RNA editing of filamin on receptor interactions
Robert Aufreiter
Art der Arbeit
Diplomarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Franz-Michael Jantsch
DOI
10.25365/thesis.29883
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-30164.49289.856553-7
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Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Ein Nucleotid der FLNA (Filamin A) mRNA wird durch A->I RNA-Editing modifiziert. Dadurch ändert sich die Aminosäure 2341 in Domäne 22 von Glutamin (Q) in Arginin (R). Dieses RNA-Editing ist hoch konserviert und in einer Region in der viele Interaktionspartner von FLNA binden. Daher kann angenommen werden, dass dieses RNA-Editing die Interaktionen beeinflusst.
Die 4 Rezeptoren CTR, GRM5, INSR und ITGB7 binden an FLNA und wurden in diesem Projekt verwendet.
Die Rezeptoren wurden einmal mit C-terminalem FLAG-Tag und einmal mit einem FLAG-Tag nach dem Signalpeptid kloniert. M2 Zellen, die keine endogenes FLNA exprimieren, wurden verwendet um Zelllinien zu erzeugen, die nicht-editiertes FLNA, editiertes FLNA oder einen der Rezeptoren stabil exprimieren. Die Zelllinien mit stabiler Expression von nicht-editiertem / editiertem FLNA wurden dann mit den Rezeptoren transfiziert und Zelllinien, die stabil alle Kombinationen aus nicht-editiertem / editiertem FLNA mit CTR, INSR und ITGB7 exprimieren, wurden erzeugt.
Zusätzlich wurden die Zelllinien für Kolokalisationsstudien, Western Blots und Co-IPs verwendet um die Interaktion zwischen Rezeptor und nicht-editiertem / editiertem FLNA zu analysieren.
Abstract
(Englisch)
One nucleotide of FLNA (Filamin A) mRNA is modified by A to I RNA editing. This changes the amino acid 2341 in repeat 22 from glutamine (Q) to arginine (R). This editing site is highly conserved and in a region where many interaction partners of FLNA bind. Thus one can expect that this editing has some influence on the interactions.
The four receptors CTR, GRM5, INSR and ITGB7 bind to FLNA and were used in this project.
The receptors were cloned once with C-terminal FLAG-tag and once with FLAG-tag after the signal peptide. M2 cells, which do not express endogenous FLNA, were used to create cell lines stably expressing unedited FLNA, edited FLNA or one of the receptors. The cell lines with stable expression of unedited / edited FLNA were then transfected with the receptors and cell lines stably expressing all combinations of unedited / edited FLNA with CTR, INSR, and ITGB7 were selected.
In addition the cell lines were used for colocalization studies, Western blots and co-IPs to analyse the interaction of the receptors with unedited / edited FLNA.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
FLNA CTR GRM5 INSR ITGB7 Filamin RNA editing
Schlagwörter
(Deutsch)
FLNA CTR GRM5 INSR ITGB7 Filamin RNA editing
Autor*innen
Robert Aufreiter
Haupttitel (Englisch)
Impact of RNA editing of filamin on receptor interactions
Paralleltitel (Deutsch)
Auswirkung von RNA-Editing von Filamin auf Rezeptor Interaktionen
Publikationsjahr
2013
Umfangsangabe
131 S.
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Franz-Michael Jantsch
AC Nummer
AC11726465
Utheses ID
26649
Studienkennzahl
UA | 441 | | |