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Outer membrane vesicles in "Bordetella petrii"
Tina Mahdavian
Art der Arbeit
Diplomarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Sylvia Hagemann
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Alle Rechte vorbehalten / All rights reserved
DOI
10.25365/thesis.30483
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29433.82247.791153-1
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Abstracts

Abstract
(Deutsch)
Gram-negative Bakterien geben während ihres Wachstums spezielle Vesikel, die als Outer Membran Vesicles (OMVs) oder Membran-Vesicle-like Particles bezeichnet werden, ab. Diese Arbeit befasst sich mit den OMVs, welche vom Bakterium Bordetella petrii abgegeben werden, und zwar mit besonderem Fokus auf die Zeitspanne, in der die Partikel-Abgabe beginnt, auf die Morphologie der besagten Partikel sowie auf ihre DNA. Derzeit ist bekannt, dass vor allem marine Bakterien, die Großteils noch nicht identifiziert worden sind, OMVs mit großen, linearen DNAs zwischen 20-500 kbp produzieren. Basierend auf diesem Wissen wurde das Bakterium Bordetella petrii zwecks OMV-DNA-Isolierung kultiviert und in verschiedenen Stadien des bakteriellen Wachstums die OMVs mittels Filtration und Ultrazentrifugation von den Bakterien getrennt, um die DNA aus den Vesikeln zu extrahieren, zu klonieren und zu sequenzieren. Dafür wurde die extrahierte, hoch-molekulare DNA mechanisch fragmentiert und eine Shotgun-Library hergestellt. 43 Klone dieser Sequenzbibliothek wurden sequenziert und die Sequenzdaten wurden computergestützt ausgewertet.
Abstract
(Englisch)
Gram-negative bacteria spontaneously release certain vesicles during their growth that are described as Outer Membrane Vesicles (OMVs) or Membrane Vesicle like Particle. This study focuses on the OMVs released by Bordetella petrii, with added attention to the timeframe in which the particle release is initiated by the organism, to the morphology of said particles as well as their DNA and its functionality Currently, it is known that marine bacterial strains – that are, for the most part unidentified – produce outer membrane vesicles containing a large, linear DNA (20 – 500kb). This knowledge inspired the cultivation of the bacterium Bordetella petrii for OMV isolation by utilizing filtration and ultracentrifugation at a variety of bacterial culture ages, while the DNA of the released particles was extracted and sequenced. For this, the extracted, high-molecular-weight DNA was mechanically fragmented and a shotgun library established. 43 clones of this library were sequenced and the sequences were computer-assisted analyzed.

Schlagwörter

Schlagwörter
(Englisch)
bacteria Bordetella petrii membrane vesicles horizontal genetransfer
Schlagwörter
(Deutsch)
Bakterien Bordetella petrii Membranvesikel Horizontaler Gentransfer
Autor*innen
Tina Mahdavian
Haupttitel (Englisch)
Outer membrane vesicles in "Bordetella petrii"
Paralleltitel (Deutsch)
Außenmembranvesikel in Bordetella petrii
Publikationsjahr
2013
Umfangsangabe
73 S. : Ill., graf. Darst.
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Sylvia Hagemann
Klassifikationen
42 Biologie > 42.13 Molekularbiologie ,
42 Biologie > 42.20 Genetik ,
42 Biologie > 42.30 Mikrobiologie
AC Nummer
AC11186287
Utheses ID
27168
Studienkennzahl
UA | 442 | | |
Universität Wien, Universitätsbibliothek, 1010 Wien, Universitätsring 1