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Klassifizierung der bakteriellen Begleitflora in veterinärmedizinischen Proben
Sandra Baumgardt
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Hans-Jürgen Busse
DOI
10.25365/thesis.30503
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29344.40744.172264-9
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Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Im Zuge dieser Arbeit wurden verschiedene Bakterienisolate der Begleitflora von veterinärmedizinischen Proben molekularbiologisch und chemotaxonomisch untersucht und anschließend klassifiziert. Für die molekularbiologische Analyse wurde das Haushaltsgen groEL und die Intergenische Region sequenziert bzw. die Fingerabdruckanalysen (ERIC- und REP-PCR) durchgeführt. Zu den taxonomischen Methoden zählen die Analyse der respiratorischen Chinone, die Analyse der polaren Lipide und der Polyamine.
Das Isolat 4284/11 konnte als neue Art des Genus Luteimonas klassifiziert werden. Das Chinonsystem weißt Ubichinon 8 als Hauptkomponente auf. Die Hauptkomponenten der polaren Lipidmuster sind Diphosphatidylglycerol und Phosphatidylethanolamin. Spermidin und Spermin dominieren das Polyaminmuster. Die Analyse des Haushaltgens und der intergenischen Region zeigte, dass das Isolats 4284/11 dem Genus Luteimonas angehört. Im Laufe der Untersuchungen konnte festgestellt werden, dass der Referenzstamm Luteimonas aestuarii DSM 19680T genauer analysiert und dessen Position in der Taxonomie überprüft werden sollte.
Die Zuordnung des Isolats 1438/12 zum Genus Chryseobacterium gilt als abgesichert. Das Isolat 1438/12 besitzt ausschließlich Menachinon 6 und als Hauptkomponente des polaren Lipidmuster Phosphatidylethanolamin. Die Hauptkomponente der Polyamine ist sym-Homospermidin.
Das Isolat 2776/12 konnte aufgrund der Sequenzierung des 16S rRNA kodierenden Gens dem Genus Streptococcus zugeordnet werde. Die Hauptkomponenten der polaren Lipide sind Diphosphatidylglycerol, die Glykolipide GL1 bis GL6 sowie die Phosphoglykolipide PGL1 und PGL2 und bei den Polyaminen bilden Spermidin und Spermin die Hauptkomponenten.
Die 16S rRNA Genanalyse der Isolate 2385/12 und 2673/12 sowie die chemotaxonomischen Methoden liefern Beweise dafür, dass es sich um neue Arten des Genus Corynebacterium handelt. Die Ergebnisse wurden zusammengefasst und als Manuskript in diese Arbeit eingegliedert, in Zusammenarbeit mit den in der Autorenliste aufgeführten Personen.
Die Isolate 1566/10, 1819/10, 1906/10, 2428/10 und 2459/10 konnten mittels chemotaxonomischer als auch aufgrund der Fingerabdruckanalysen dem Stamm Acinetobacter baumannii zugeordnet werden. Das Chinonsystem besteht hauptsächlich aus
Ubichinon 9. Alle fünf Isolate weisen als Lipidhauptkomponenten Phosphatidylethanolamin, Phosphatidylglycerol und ein nicht identifiziertes Aminophospholipid auf. Die ERIC- und REP-Fingerabdruckanalysen zeigten ausgezeichnete Übereinstimmungen auch zu dem Referenz-stamm A. baumanii ATCC 19606T.
Das Isolat 114, ebenfalls dem Genus Acinetobacter zugehörig, konnte als neue Art klassifiziert werden. Ubichinon 9 ist die Hauptkomponente des Chinonsystems. Das Muster der polaren Lipide wird dominiert von Diphosphatidylglycerol, Phosphatidylethanolamin, Phosphatidylserin und ein nicht identifiziertes Aminophospholipid. Hauptsächlich konnte beim Isolat 114 1,3-Diaminopropan detektiert werden. Die Ergebnisse wurden der Arbeitsgruppe von Gottfried Wilharm (Robert Koch Institut, Wernigerode) übermittelt und sollen publiziert werden.
Alle Acinetobacter Isolate zeigen ein unterschiedliches Bandenmuster nach der Amplifizierung der Intergenischen Region, welches zur Identifizierung der Acinetobacter Stämme eingesetzt werden kann.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
Mikrobiologie/ Klassifizierung Bakteriensystematik
Autor*innen
Sandra Baumgardt
Haupttitel (Deutsch)
Klassifizierung der bakteriellen Begleitflora in veterinärmedizinischen Proben
Publikationsjahr
2013
Umfangsangabe
106 S. : Ill., graph. Darst.
Sprache
Deutsch
Beurteiler*in
Hans-Jürgen Busse
Klassifikation
42 Biologie > 42.30 Mikrobiologie
AC Nummer
AC11818871
Utheses ID
27182
Studienkennzahl
UA | 066 | 830 | |