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Identification of potential Ribonuclease A inhibitors by in silico screening
Katsiaryna Bulyha
Art der Arbeit
Diplomarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Gerhard Ecker
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29422.47318.302461-7
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Adipositas oder Fettsucht wird mit zahlreichen Krankheiten assoziiert, wie zum Beispiel Herz-Kreislauferkrankungen, Diabetes Mellitus Typ 2, Arthritis, einigen Krebsarten und Bluthochdruck. Die häufigste Behandlungsmethode ist heutzutage die Änderung der Lebensgewohnheiten, durch eine kalorienreduzierte Diät und sportliche Betätigung. Jedoch ist der Erfolg solch einer Therapie oft unzureichend. Magenverkleinerung und einige pharmakologischen Behandlungen führen zu einem gewissen Gewichtsverlust, sind jedoch auch mit vielen Nebenwirkungen verbunden. Übergewichtige Patienten weisen meistens sowohl eine Vergrößerung der Adipozyten auf, als auch eine Erhöhung der Anzahl der Zellen. Die bereits erwähnten Behandlungsmethoden bewirken jedoch nur eine Reduktion der Adipozytengroesse, aber nicht deren Anzahl.
Ribonuclease A, ein Enzym das zu der Ribonuclease A Überfamilie gehört, wird mit Adipositas assoziiert. Das Enzym wird im Fettgewebe expremiert. Neuen Studien zufolge führt eine Hemmung der RNase A zu einer Reduktion der Adipozytenanzahl. Aus diesem Grund bietet Ribonuclease A einen neuen Angriffspunkt zur der Entwicklung von Arzneistoffen zur Behandlung von Adipositas.
Das Ziel dieser Arbeit war es, mit Hilfe von strukturbasiertem in silico Screening mögliche Inhibitoren der Ribonuclease A zu identifizieren. Nach der Erstellung eines strukturbasierten Pharmakophormodells wurde die LifeChemicals Datenbank gescreent. Die dadurch gefundenen Verbindungen wurden mit ChemGPS-NP analysiert. Zur finalen Priorisierung der Hitliste wurden Docking Methoden angewandt. Als Ergebnis wurden 51 Verbindungen identifiziert, die zur Zeit auf ihre Ribonuclease Inhibierungsaktivität getestet werden.
Abstract
(Englisch)
Obesity is a major health problem in many countries of the world. Weight gain is associated with several diseases. It is linked to cardiovascular disease, diabetes mellitus, osteoarthritis, some forms of cancer and sleep-breathing disorders. The common treatment option nowadays is lifestyle change including diet with calorie restriction and physical exercise. However, the treatment often remains without success. Bariatric surgery and some pharmacological treatments also exist. They lead to moderate weight loss but also possess a lot of side effect and compliance problems. Obese individuals have an increased adipocyte size as well as adipocyte number. However, the treatment options listed above just interact with adipocyte size not number.
According to recent studies, Ribonuclease A, an enzyme of the ribonuclease family, is associated to obesity. The enzyme is expressed in adipose tissue and findings show that inhibition of RNase A leads to decreased adipocyte number. Because of this, Ribonuclease A is an interesting novel target for drug development for treatment of obesity.
The aim of this study is to identify new ligands that can act as antagonists for Ribonuclease A by structure-based in silico screening. First, a structure-based pharmacophore model has been created and used for screening of the LifeChemicals database. The obtained hit compounds were further analyzed using the ChemGPS-NP web service. For final priorisation of the hit list, also docking studies were performed. As a result, 51 compounds were identified, which are currently tested for Ribonuclease A inhibition activity.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
Ribonuclease A Inhibitoren Adipositas
Autor*innen
Katsiaryna Bulyha
Haupttitel (Englisch)
Identification of potential Ribonuclease A inhibitors by in silico screening
Paralleltitel (Deutsch)
Identifizierung potenzieller Ribonuclease A Inhibitoren durch in silico Screening
Publikationsjahr
2013
Umfangsangabe
85 S. : Ill., graph. Darst.
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Gerhard Ecker
Klassifikation
44 Medizin > 44.42 Pharmazeutische Chemie
AC Nummer
AC11216324
Utheses ID
27478
Studienkennzahl
UA | 449 | | |