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Regulation and role of RNA Pol II CTD phosphorylation in the transcription cycle of the Nos2 gene
Bernadette Stych
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Betreuer*in
Thomas Decker
DOI
10.25365/thesis.32831
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29590.67218.995670-9
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Listeria monocytogenes ist eines der am besten charakterisierten und am meisten untersuchten intrazellulären Pathogene. Unser Labor untersucht, die Reaktion des angeborenen Immunsystems auf Listerien-Infektionen, und wie die Effektoren der Immunabwehr reguliert werden. Viele antimikrobielle Gene in infizierten Zellen (z.B. Makrophagen) werden von NFκB und dem Typ-I-interferon/ISGF3-Weg reguliert. Zu dieser Gruppe gehört auch das Nos2 Gen, das die induzierbare Stickstoffmonoxid-Synthase (iNOS) kodiert. Mein Projekt konzentrierte sich auf Phosphorylierungsereignisse an der carboxyterminalen Domäne (CTD) der RNA-Polymerase II (RNA Pol II) während des Transkriptionszykluses des Nos2 Gens. Modifikationen dieser Domäne sind unerlässlich für die Funktion der RNA-Pol II. Ich konnte in dieser Arbeit mit Hilfe von Chromatin- Immuno- Präzipitation (ChIP) zeigen, dass die Phosphorylierung von Serin 2 in BMDMs, stimuliert mit Listeria-abgeleiteten Signalen Richtung 3 'Ende des Nos2 Gens stark ansteigt. Im Gegensatz dazu ist Serin 5 stark am Transkriptionsstart (TSS) phosphoryliert, dies stimmt mit seiner bekannten Rolle in der Trennung der RNA Pol II vom Promotor überein. Interessanterweise bleibt das Niveau bis zum 3'-Ende des NOS2 Gens konstant. Außerdem konnte ich zeigen, dass Serin 7 Phosphorylierung am TSS signifikant erhöht ist aber unmittelbar danach stark abnimmt. Es könnte eine wichtige Rolle bei der Initiation, der Übergang zur Elongation oder bei der Rekrutierung von Spleißfaktoren spielen. Der zweite Teil der Arbeit beschreibt eine Klonierungsstrategie zur Schaffung eines Fusionsgenes aus der p50-Untereinheit von NFκB und einer der Cyclin-abhängigen Kinasen, Cdk7 oder Cdk9 die für diese Modifikationen verantwortlich sind. In der Folge könnten mit diesen Fusionskonstrukten weitere Untersuchungen am Promoter des NOS2 Gens durchgeführt werden.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
Nos2 gene CTD of the RNA Polymerase II Serine phosphorylation Listeria monocytogenes innate immunity
Schlagwörter
(Deutsch)
Nos2 Gen CTD der RNA Polymerase II Serin Phosphorylierung Listeria Monocytogenes angeborenes Immunsystem
Autor*innen
Bernadette Stych
Haupttitel (Englisch)
Regulation and role of RNA Pol II CTD phosphorylation in the transcription cycle of the Nos2 gene
Paralleltitel (Deutsch)
Regulation und Rolle der RNA Pol II CTD Phosphorylierung im Transcriptionzykluses des Nos2 Gens
Paralleltitel (Englisch)
Regulation and role of RNA Pol II CTD phosphorylation in the transcription cycle of the Nos2 gene
Publikationsjahr
2014
Umfangsangabe
59 S. : Ill., graf. Darst.
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Thomas Decker
Klassifikation
42 Biologie > 42.13 Molekularbiologie
AC Nummer
AC12037141
Utheses ID
29154
Studienkennzahl
UA | 066 | 830 | |