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Interferon immune response to "Candida glabrata" in dendritic cells
Valentina Stolz
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Betreuer*in
Karl Kuchler
DOI
10.25365/thesis.34229
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-30188.69949.109664-7
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Candida glabrata ist häufig vorkommender Pilz - Pathogen im Menschen. Er verursacht keine Infektionen in gesunden Wirten, kann allerdings ernstzunehmende Krankheiten in immunsupprimierten Individuen auslösen. Dort befällt er vor allem Schleimhäute, kann sich aber auch systemisch durch den Blutkreislauf verbreiten. Aufgrund des hohen Anstiegs an immunsupprimierten Patienten in den letzten Jahren wurden Infektionen der Gattung Candida zu einem bedeutendem Gesundheitsproblem. Dendritische Zellen spielen eine tragende Rolle während einer Infektion mit C. glabrata, da sie im Körper die Aufgabe Antigen - präsentierender Zellen übernehmen. Es ist bekannt, dass Typ I Interferone wichtig während einer Infektion mit Candida sind. Während des Experiments wurden Dendritische Zellen mit C. glabrata infiziert, um eine zeitabhängige Isolierung von Maus- und Candida RNA zu durchzuführen. Um den Zusammenhang zwischen type I IFNs und Candida - Infektionen besser zu verstehen, wurde das Experiment nicht nur mit Wild Typ Mäusen, sondern auch mit Mäusen durchgeführt, die einen Defekt in der Signalweiterleitung durch type I IFNs haben. Um unsere Fragestellung zu erläutern, entschieden wir uns für eine Methode namens ,,parallel dual - species RNA Sequenzierung“. Diese Methode liefert innerhalb kurzer Zeit eine große Menge an Informationen, und ermöglicht es, nicht nur Daten eines Organismus zu erfassen, sondern mehrerer Organismen gleichzeitig. Die Methode ermöglichte es uns, Gene in beiden Organismen zu identifizieren, die zeitabhängig differenziell exprimiert wurden. Zusätzlich konnten wir 3 Gene in C. glabrata identifizieren, die wichtig erscheinen, da wir zeigen konnten, dass der Verlust dieser Gene eine geringere Überlebensrate des Fungus während einer Infektion zur Folge hatte.
Abstract
(Englisch)
Candida glabrata is one of the most prevalent fungal pathogens in human. In the healthy host, C. glabrata does not lead to an infection. However, in immunocompromised individuals, C. glabrata can cause mucosal and blood stream infections. Candida infections became a major health problem due to the high incidence of immunosuppression. Dendritic cells play a crucial role in the detection and removal of C. glabrata. Previous reports suggest type I IFNs as being one of the most important signaling molecules during infections with Candida species. Murine bone - marrow - derived dendritic cells were differentiated in vitro, and time - dependent transcriptomics of both M. musculus and C. glabrata RNA changes was performed. To address the role of type I IFNs during C. glabrata - induced immune responses, not only wild type, but also cells, which lack a functional receptor for type I IFNs, were used for the experiments. Parallel dual - species RNA sequencing (RNA Seq), which allows one to look at the whole transcriptome of one or more organisms at the same time, was performed. Dual - species differential gene expression was investigated both in murine and in Candida cells. Additionally, we identified 3 novel genes in C. glabrata, that seem to be important during infection, since the loss of these genes resulted in a reduced survival rate of C. glabrata during infection with BMDCs. These genes have, to our knowledge, not been associated with C. glabrata infections so far.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
Candida Glabrata Dendritic Interferon Sequencing Transcriptomics Bioinformatics
Schlagwörter
(Deutsch)
Candida Glabrata Dendritische Zellen Sequencing Transcriptomics Bioinformatik Interferon
Autor*innen
Valentina Stolz
Haupttitel (Englisch)
Interferon immune response to "Candida glabrata" in dendritic cells
Paralleltitel (Deutsch)
Interferon Immun - Antwort in Dendritischen Zellen auf Candida Glabrata
Publikationsjahr
2014
Umfangsangabe
82 S. : Ill., graph. Darst.
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Karl Kuchler
Klassifikationen
30 Naturwissenschaften allgemein > 30.00 Naturwissenschaften allgemein: Allgemeines ,
30 Naturwissenschaften allgemein > 30.03 Methoden und Techniken in den Naturwissenschaften ,
42 Biologie > 42.13 Molekularbiologie ,
42 Biologie > 42.30 Mikrobiologie ,
44 Medizin > 44.45 Immunologie ,
44 Medizin > 44.47 Pathologie ,
54 Informatik > 54.99 Informatik: Sonstiges
AC Nummer
AC12159769
Utheses ID
30383
Studienkennzahl
UA | 066 | 830 | |