Detailansicht
Vergleichende Untersuchung zur Taxonomie der Genera "Massilia" und "Telluria"
Ivana Orthová
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
Hans-Jürgen Busse
DOI
10.25365/thesis.34278
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29684.57051.290264-4
Link zu u:search
(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Die Ergebnisse der vorliegenden Arbeit aus der Analyse der polaren Lipide und der partiellen gyrB und lepA Haushaltsgene von Telluria chitinolytica CIP 104069ᵀ und Telluria mixta CCUG 35206ᵀ stellen Indizien für eine Zusammenführung der Genera Massilia und Telluria dar.
Ferner können die im Rahmen dieser Arbeit untersuchten Isolate NS9, Oxalobacteraceae bacterium Ma und E-JS-7 als neue Spezies des Massilia/ Telluria Clusters angesehen werden. Die partiellen Sequenzähnlichkeitswerte der 16S rRNA, lepA und gyrB Gene lagen für alle drei Isolate unterhalb der für Massilia und Telluria Vertreter beobachteten Grenzen zur Separierung von Spezies. Basierend auf den 16S rRNA Gensequenzähnlichkeiten sowie den 16S rRNA Stammbäumen stellt die Spezies T. mixta CCUG 35206ᵀ den nächsten Verwandten des Isolats Oxalobacteraceae bacterium Ma; M. aerilata 5516S-11T den nächsten Verwandten des Isolats NS9 und T. chitinolytica CIP 104069ᵀ die nächst verwandte Spezies des Isolats E-JS-7 dar. Bei allen drei Isolaten konnte die Verwandtschaft durch 16S rRNA (1327 Bp) Sequenzähnlichkeiten (>97.0 %), sowie durch eine in 16S rRNA (1327 Bp) Stammbäumen gemeinsame Clusterung mit der jeweiligen Spezies untermauert werden. Die Zugehörigkeit der Isolate Oxalobacteraceae bacterium Ma, NS9 und E-JS-7 zum Massilia/ Telluria Cluster konnte auch anhand der partiellen lepA und gyrB Nukleotid- und Aminosäuresequenzähnlichkeiten und in den korrespondierenden Stammbäumen gezeigt werden, in welchen sich teilweise mit dem 16S rRNA Gen übereinstimmende Positionierungen innerhalb des Massilia/ Telluria Clusters ergaben.
Abstract
(Englisch)
The results of this study obtained from the analysis of polar lipids and partial gyrB and lepA housekeeping genes of Telluria chitinolytica CIP 104069ᵀ and Telluria mixta CCUG 35206ᵀ form a basis for merging of the genera Massilia and Telluria. Furthermore, the isolates NS9, Oxalobacteraceae bacterium Ma and E-JS-7 should be considered as new species of the Massilia/ Telluria group. The partial sequence similarities in 16S rRNA, gyrB and lepA genes identified members of the Massilia/ Telluria group as next relatives. Based on 16S rRNA (1327 bp) sequence similarities (>97.0 %) and 16S rRNA (1327 bp) based phylogenetic analyses, the species T. mixta CCUG 35206T was shown to be the closest relative of the isolate Oxalobacteraceae bacterium Ma; M. aerilata 5516S-11T to be the closest relative of the isolate NS9 and T. chitinolytica CIP 104069T to be the closest related species of the isolate E-JS-7. The affiliation of the isolates Oxalobacteraceae bacterium Ma, NS9 and E-JS-7 to the Massilia/ Telluria group could also be demonstrated on the basis of partial lepA and gyrB nucleotide and protein sequence similarities and corresponding phylogenetic trees. The phylogenetic positioning of the isolates Oxalobacteraceae bacterium Ma, NS9 and E-JS-7 within the gyrB and lepA nucleotide and protein phylogenetic trees matched quite well to the 16S rRNA phylogeny, though several exceptions were found.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
Taxonomy Massilia Telluria polar lipids housekeeping genes
Schlagwörter
(Deutsch)
Taxonomie Massilia Telluria polare Lipide Haushaltsgene
Autor*innen
Ivana Orthová
Haupttitel (Deutsch)
Vergleichende Untersuchung zur Taxonomie der Genera "Massilia" und "Telluria"
Publikationsjahr
2014
Umfangsangabe
VIII, 169 S. : Ill., graph. Darst.
Sprache
Deutsch
Beurteiler*in
Hans-Jürgen Busse
Klassifikation
42 Biologie > 42.13 Molekularbiologie
AC Nummer
AC12178902
Utheses ID
30429
Studienkennzahl
UA | 066 | 830 | |