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Functional analysis of the polymorphic tandem repeats minisatellite MNS16A of human telomerase gene in prostate and lung cancer cell lines
Christian Behm
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Molekulare Biologie
Betreuer*in
Andrea Gsur
DOI
10.25365/thesis.40096
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29480.75806.826766-3
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Der polymorphe Minisatellit MNS16A befindet sich downstream des humanen Telomerase Reverse Transcriptase (hTERT) Gens, in der Promoterregion des antisense hTERT Transkriptes. MNS16A wurde in zahlreichen molekular-epidemiologischen Studien als möglicher Biomarker für unterschiedliche Krebserkrankungen untersucht. Im Zuge dieser Studien wurden bisher sechs verschiedene Varianten mit einer variablen Anzahl an Tandemwiederholungen (VNTRs) von MNS16A identifiziert.
Ziel der vorliegenden Masterarbeit war, zum ersten Mal, der Funktionalitätsnachweis aller sechs bekannten MNS16A Varianten, nicht nur in der Lungenkrebs-Zelllinie A-427, sondern auch in der Prostatakrebs-Zelllinie LNCaP, unter Verwendung eines Dual-Luciferase Reporter Systems.
Alle sechs MNS16A VNTRs zeigten eine statistisch signifikante Promoteraktivität in beiden Krebszelllinien. In der Prostatakrebs-Zelllinie zeigte sich eine statistisch signifikante Zunahme der Promoteraktivität mit abnehmender MNS16A Länge. Dies deutet auf ein starkes negatives lineares Verhältnis (p=0.00078) in der Prostatakrebs-Zelllinie hin. Allerdings konnte dieses Verhältnis in die Lungenkrebs-Zelllinie A-427 nicht bestätigt werden. Obwohl in A-427 das längste Allel eine deutlich geringere Promoteraktivität aufweist als die übrigen MNS16A Varianten, gelang es nicht, einen statistisch signifikanten Unterschied in der Aktivität der kürzeren Allele nachzuweisen.
Diese Resultate weisen auf ein unterschiedliches Verhalten von MNS16A in unterschiedlichen Krebszellen hin. Weitere Studien, die die MNS16A Funktionalität in zusätzlichen Lungen- und Prostatakrebs-Zelllinien und in anderen Krebszelllinien untersuchen, können zur weiteren Aufklärung der MNS16A Funktionalität beitragen
Abstract
(Englisch)
MNS16A, a polymorphic tandem repeats minisatellite in the promoter region of the antisense transcript of the human telomerase reverse transcriptase (hTERT) gene, has been discussed as a biomarker in several malignancies.
The present master thesis investigated, for the first time, the functionality of all six known MNS16A VNTRs in the lung cancer cell line A-427 and the prostate cancer cell line LNCaP, using a Dual-Luciferase reporter assay system.
All six MNS16A VNTRs showed statistically significant promoter activity in both cancer cell lines. LNCaP exhibited a statistically significant increase of promoter activity with decreasing MNS16A length for all six considered VNTRs, reflecting a strong negative linear relationship (p=0.00078) in the prostate cancer cell line. However, this trend was not observed in A-427. In A-427, VNTR-364, the longest allele, showed the lowest promoter activity, however no significant differences between the remaining five VNTRs were observed.
These results suggest that MNS16A functionality might differ in different cancer cell types and may not follow a linear function in all cell lines as observed in LNCaP. Further studies are warranted to investigate MNS16A functionality in additional prostate and lung cancer cell lines and in various other cancer cell lines.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
MNS16A polymorphic minisatellite VNTRs promoter activity prostate cancer lung cancer telomerase hTERT luciferase assay
Schlagwörter
(Deutsch)
MNS16A polymorpher Minisatellit Variable Anzahl an Tandemwiederholungen Promotoraktivität Prostatakrebs Lungenkrebs Telomerase hTERT Luciferase Assay
Autor*innen
Christian Behm
Haupttitel (Englisch)
Functional analysis of the polymorphic tandem repeats minisatellite MNS16A of human telomerase gene in prostate and lung cancer cell lines
Paralleltitel (Deutsch)
Funktionelle Analyse des polymorphen Minisatelliten MNS16A des humanen Telomerasegens in Prostata- und Lungenkrebszelllinien
Publikationsjahr
2015
Umfangsangabe
X, 70 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Andrea Gsur
Klassifikationen
42 Biologie > 42.13 Molekularbiologie ,
44 Medizin > 44.99 Medizin: Sonstiges
AC Nummer
AC13009184
Utheses ID
35518
Studienkennzahl
UA | 066 | 834 | |