Detailansicht
Disease associated protein alteration of platelets of melanoma patients is associated with characteristic eicosanoid patterns in the releasate
Benjamin Neuditschko
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Chemie
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Biologische Chemie
Betreuer*in
Christopher Gerner
DOI
10.25365/thesis.43784
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-21424.62461.108868-7
Link zu u:search
(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Um ein besseres Verständnis biologischer Systeme vor allem in Zusammenhang mit schweren Krankheiten wie Krebs zu erreichen, werden heute Genomic, Transcriptomic, Proteomic Lipidomic und Metabolomic Methoden in der Forschung verwendet. Aber nicht nur die Prozesse die zur Entwicklung von Tumoren führen sind dabei interessant, sondern auch wie eine Krebserkrankung das ganze System beeinflussen kann. Blutplättchen können einerseits den Verlauf einer solchen Erkrankung beeinflussen andererseits gibt es aber auch Hinweise darauf, dass sie selbst im Laufe einer schweren Krankheit verändert werden.
Diese Arbeit stellt eine analytische Methode vor, welche es ermöglicht die bei Aktivierung freigesetzten Eicosanoide von Blutplättchen zu analysieren. Dafür wurden Blutplättchen von vier Patienten mit Melanom und einem gesunden Spender entnommen und gereinigt. Die Plättchen wurden mit Ionomycin aktiviert um eine Ausschüttung der Eicosanoide zu erreichen. Die Proteine des Überstands wurden ausgefällt und die Eicosanoide mit einer Festphasen-Extraktion gereinigt. Die Lipide wurden mittels eines HPLC-MS/MS Systems analysiert, und die Daten manuell ausgewertet.
Mit dieser Methode konnten 28 verschieden Eicosanoide unter anderem HETEs, PGs, Hepoxilin und Thromboxan identifiziert werden. Acht weitere Eicosanoide konnten mit geringerer Sicherheit identifiziert werden, werden aber dennoch in den Proben vermutet. Die Lipide wurden quantifiziert und die Werte der Kontrollproben mit denen der 15 Minuten und drei Stunden aktivierten verglichen. Dies zeigt einerseits die Unterschiede zwischen den einzelnen Subklassen der Eicosanoide. Die HETEs zum Beispiel zeigen eine sehr starke Erhöhung nach drei Stunden wohingegen die PGs nur eine sehr geringe Erhöhung zeigen. Andererseits gibt es einen signifikanten Unterschied zwischen den Patienten und dem gesunden Spender. Insgesamt zeigen die Plättchen der erkrankten Spender eine sehr viel geringere Ausschüttung von Lipiden als die gesunden Blutplättchen, was ein Anzeichen dafür sein kann, dass sie die Plättchen in einem erschöpften Zustand befinden und ihre Aktivität unterschiedlich ist, je nachdem in welchem Stadium sich die Krankheit befindet.
Abstract
(Englisch)
In order to achieve a better understanding of biological systems per se but especially in correlation with different severe diseases like cancer genomic, transcriptomic, proteomic, lipidomic and metabolomic methods are today widely used for research. But not only the processes that influence the development and progression of tumors are interests of research but also how the cancer affects the whole system. The blood platelets are described to influence cancer and on the other hand are changed by cancer themselves [5].
This work presents an analytical method that allows the analysis of the releasate pattern of eicosanoids of blood platelets. Therefore blood platelets of four patients diagnosed with melanoma and one healthy donor were derived and purified. The platelets have been activated with ionomycin in order to achieve the production and release of eicosanoids. The proteins of the supernatant were precipitated and the eicosanoids purified with a solid-phase extraction. The lipids were analysed using a HPLC-MS/MS system and the data was evaluated manually.
With this method 28 eicosanoids including HETEs, PGs, thromboxane, hepoxilin and others could be identified and quantified. Additional 8 eicosanoids were identified with lower certainty but are believed be in the sample as well. The lipids were quantified and the values of the control samples were compared to the ones of the platelets activated for 15 minutes or three hours. This showed, on the one hand, a difference between the distinct subclasses of eicosanoids. The HETEs for example showed a very high fold change whereas the PGs showed very little change. On the other hand, there was a visible difference between the patients and the healthy donor. Overall the diseased platelets showed a much lower fold change than the healthy platelets, which could be an indicator for an exhaustion of the platelets and a change in the activity in different stages of the disease.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
platelets eicosanoids HPLC-MS lipidomics melanoma
Schlagwörter
(Deutsch)
Blutplättchen Eicosanoide HPLC-MS Lipidomics Melanoma
Autor*innen
Benjamin Neuditschko
Haupttitel (Englisch)
Disease associated protein alteration of platelets of melanoma patients is associated with characteristic eicosanoid patterns in the releasate
Paralleltitel (Deutsch)
Krankheitsbedingte Änderung der Proteine in Plättchen von Melanoma Patienten ist assoziiert mit charkteristischen Eicosnaoidmustern im Überstand
Publikationsjahr
2016
Umfangsangabe
VII, 53 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Christopher Gerner
AC Nummer
AC13427092
Utheses ID
38763
Studienkennzahl
UA | 066 | 863 | |