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Docking studies on bacterial encymes MurD and PBP2a
Mitja Maximilian Zdouc
Art der Arbeit
Diplomarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Diplomstudium Pharmazie
Betreuer*in
Thierry Langer
DOI
10.25365/thesis.44420
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-13741.47760.732969-7
Link zu u:search
(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Zunehmende mikrobielle Resistenz gegen Antibiotika ist ein weltweites Ge-
sundheitsproblem. Antibiotika mit neuartigen Wirkungsmechanismen sind
dringend gesucht, da sich Bakterien schnell an Substanzen anpassen und
Kreuzresistenzen häufig sind. In der vorliegenden Arbeit wurde versucht
dieser Entwicklung mittels computergestützter Methoden entgegenzusteuern.
Untersucht wurden die Proteine PBP2a und MurD, die beide eine Schlüssel-
position in der bakteriellen Zellwandsynthese einnehmen. Genutzt wurden
die Programme LiSiCA, ein ”Similarity-Search” Programm, sowie AutoDock
Vina, ein ”Molecular Docking” Programm. Die am besten bewerteten Mole-
küle wurden erworben und biologisch validiert. Dabei wurde über die ”Sim-
ilarity Search” Methode ein Molekül mit niedrig mikromolarer inhibitorischer
Aktivität gegenüber PBP2a gefunden. Die Bestimmung der minimalen Hemm-
konzentration (MIC) von 16 μg/mL an S. aureus und MRSA bestätigte diesen
Treffer. Dieses Molekül könnte sich in der drohenden ”post-antibiotischen
Ära” noch als nützlich erweisen.
Abstract
(Englisch)
Increasing microbial resistance against antibiotics is a major worldwide health
problem. Antimicrobial agents with novel mechanisms of action are urgently
needed. In the present work, we addressed this problem by using compu-
tational methods to investigate bacterial cell-wall related proteins PBP2a
and MurD, in particular through recently developed similarity search pro-
gram LiSiCA and docking program AutoDock Vina. The best-performing
compounds were purchased and biologically tested. The similarity search ap-
proach yielded a compound with low micromolar inhibitory activity against
PBP2a. The compound was further confirmed through examination of min-
imal inhibitory concentrations (MIC) at 16 μg/mL. This might be an inter-
esting molecule to further prolong the threatening ”post-antibiotic” era.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
Docking Similarity Search Bacterial
Schlagwörter
(Deutsch)
Docking Similarity Search Bakteriell
Autor*innen
Mitja Maximilian Zdouc
Haupttitel (Englisch)
Docking studies on bacterial encymes MurD and PBP2a
Paralleltitel (Deutsch)
Docking Studien an den bakteriellen Enzymen MurD und PBP2a
Publikationsjahr
2016
Umfangsangabe
50 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Thierry Langer
AC Nummer
AC13380768
Utheses ID
39316
Studienkennzahl
UA | 449 | | |