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Isolation and characterization of a virus-like-particle from a novel strain of Sulfolobus Acidocaldarius
Kevin Pfeifer
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Molekulare Biologie
Betreuer*in
Christa Schleper
DOI
10.25365/thesis.47188
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-22005.08513.145153-0
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Archaeen haben sich an die extremsten Habitate, die unser Planet zu bieten hat, nicht nur angepasst,
sondern haben Wege gefunden dort zu gedeihen und diese Nischen für sich zu erobern. Hand in Hand
mit den Archaea haben sich zahlreiche Viren in diesen Habitaten entwickelt und die Fähigkeit
beibehalten, diese extremen Wirte zu infizieren. Über die letzten 30 Jahre wurden Einblicke in die
morphologische und genetische Vielfalt dieser Vieren erhalten, und mit jeder Isolierung eines weiteren
archaeellen Virus wird unser Verständnis der Entwicklung und Vielfalt dieser faszinierend
geheimnisvollen Welt etwas erweitert. Im Verlauf dieser Studie wurde ein neuer Sulfolobus
acidocaldarius Stamm aus Beppu, Japan, isoliert, der Virus-ähnliche Partikel (VAP) produziert. Dieser
wurde in Reinkultur gebracht und die produzierten VAPs wurden elektronenmikroskopisch
charakterisiert. Es war nicht möglich, ein VAP-spezifisches Genom zu isolieren, jedoch konnte gezeigt
werden, dass ein zuvor uninfizierter Stamm von S. acidocaldarius nach der Inkubation mit einem Zellfreien
VAP Konzentrat VAPs produzierte. Des Weiteren enthielt das Zell-freie VAP-Konzentrat Proteine,
die im Zellextrakt des Wirts nicht sichtbar waren. Zusammenfassend deuten die gesammelten
Resultate darauf hin, dass es sich bei diesem Virus-ähnlichen Partikel um den ersten von einem S-Layer
umschlossenen, archaeellen Virus handeln könnte.
Abstract
(Englisch)
Archaea have evolved to survive in the harshest niches this planet has to offer and alongside the
archaea, viruses have coevolved retaining their ability to infect these extremophilic populations. Over
the last 30 years, archaeal viruses were shown to be morphologically and genetically very diverse. With
each new isolation of an archaeal virus, scientists gain further insight into this enigmatic world and into
the mechanisms of evolution that have allowed the emergence of such diversity. In this study, we have
cultivated a novel, Virus-Like-Particle(VLP)-producing strain of Sulfolobus acidocaldarius from an
nvironmental sample collected in Beppu, Japan, and attempted to characterize the produced VLPs.
Transmission electron microscopy studies of the VLPs showed a unique, vesicle-like morphology with
a filamentous tail extending from one point of the main body. Although we were unable to isolate
nucleic acid from the VLP, we succeeded in initiating VLP production in a previously uninfected strain
of S. acidocaldarius after exposure to a cell free concentrate of VLPs. Further, a protein extraction from
a cell free VLP fraction showed high concentrations of proteins that were not visible in the crude
cellular extract. The evidence gathered so far supports the hypothesis that this isolated VLP could be
the first S-layer encapsulated archaeal virus. Alternatively, since its infectivity could not unambiguously
been proven, it might represent an S-layer coated vesicle released from S. acidocaldarius strains.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
Isolation Charakterization Virus-Like-Particle Sulfolobus Acidocaldarius Archaea
Schlagwörter
(Deutsch)
Isolierung Charakterisierung Virus-Artiger-Partikel Sulfolobus Acidocaldarius Archaea
Autor*innen
Kevin Pfeifer
Haupttitel (Englisch)
Isolation and characterization of a virus-like-particle from a novel strain of Sulfolobus Acidocaldarius
Paralleltitel (Deutsch)
Isolierung und Charakterisierung eines Virus-Artigen-Partikels eines neuen Sulfolobus Acidocaldarius Stammes
Publikationsjahr
2017
Umfangsangabe
67 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Christa Schleper
AC Nummer
AC14469714
Utheses ID
41762
Studienkennzahl
UA | 066 | 834 | |