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A model of motion of autophagosomes
Don Ciglenecki
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Mathematik
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Mathematik
Betreuer*in
Christian Schmeiser
DOI
10.25365/thesis.54121
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-13555.87574.690064-1
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Die Autophagie ist ein biologischer Prozess, bei dem sich ein Autophagosom durch die Zelle bewegt bis es sich an die Vakuole befestigt. Aufgrund technischer Einschränkungen kann die Bewegung nicht direkt beobachtet werden; nur die Anfangs- und Endposition des Autophagosomes kann man mit dem Mikroskop lokalisieren. Das Ziel dieser Arbeit ist es zu bestimmen, ob die Art der Bewegung allein aus Wahrscheinlichkeitsverteilung der Endposition auf der Vakuole bestimmt werden kann.
Das verwendete Model der Bewegung besteht aus zwei Komponenten; Diffusion und Advektion. Ein vereinfachtes zweidimensionales Modell wurde verwendet, um das Verhalten des theoretischen Falles der unendlichen Advektion kombiniert mit einer unendlich kleinen Absorption entlang der Vakuole zu untersuchen. Das 3-dimensionale Modell wurde mit numerischen Methoden analysiert. Die Auswirkungen verschiedener Parametergrößen wurden verglichen, um zu bestimmen, ob die Parameter aus der endgültigen Verteilung entlang der Vakuole eindeutig bestimmt werden können.
Abstract
(Englisch)
The autophagy is a biological process during which an autophagosome moves through the cell until it attaches to the vacuole. Due to technical limitations, the motion can not be observed directly; only the initial and final position of the autophagosome can be located by microscope. The aim of this thesis is to determine whether the type of motion can be specified from the probability distribution of the final location alone.
The motion has been modeled consisting from two components; diffusion and advection. A simplified 2-dimensional model has been used to examine the behavior of the theoretical case of infinite advection combined with infinitely small absorption on the vacuole. The 3-dimensional model has been analyzed by numerical methods. Effects of different parameter choices has been compared in order to specify whether they can be uniquely determined from the final distribution along the vacuole.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
autophagy advection-diffusion equation cell mathematical modeling numerical approximation
Schlagwörter
(Deutsch)
Autophagie Advektions-diffusionsgleichung Zelle mathematische Modellierung numerische Approximation
Autor*innen
Don Ciglenecki
Haupttitel (Englisch)
A model of motion of autophagosomes
Paralleltitel (Deutsch)
Ein Modell der Bewegung von Autophagosomen
Publikationsjahr
2018
Umfangsangabe
49 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Christian Schmeiser
Klassifikation
31 Mathematik > 31.80 Angewandte Mathematik
AC Nummer
AC15538911
Utheses ID
47820
Studienkennzahl
UA | 066 | 821 | |