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Functional elucidation of pathogen triggered immunity (PTI) inhibiting effectors of Ustilago maydis
Indira Saado
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Genetik und Entwicklungsbiologie
Betreuer*in
Armin Djamei
DOI
10.25365/thesis.55012
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-21471.73621.671264-0
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Das Erforschen von molekularen Mechanismen die es dem phytopathogenen Pilzen ermöglichen erfolgreich Wirtspflanzen zu kolonisieren, ist ein entscheidender Faktor für die Entwicklung von effektiven Strategien zur Verringerung von Nutzpflanzenbefall. Eine pilzliche Kolonisation bedingt dabei das pflanzlich Immunsystem zu manipulieren und zu überwinden. Die basalen induzierten Abwehrmechanismen einer Pflanze werden durch das Erkennen pathogen assoziierter Molekülen (PAMP-pathogen associated molecule pattern) über spezifische pflanzliche Rezeptoren (PRR-pattern recognition receptor) aktiviert, was letztendlich eine Immunantwort (PTI-PAMP triggered immunity) auslöst. Eine der frühesten Abwehrmaßnahmen stellt die Bildung von reaktiven Sauerstoffspezies im Apoplast (ROS burst) dar, die mit Hilfe der NADPH-Oxidase erzeugt werden. Um diese Erkennungskaskade zu unterbrechen, sekretieren Pathogene kleine Proteinmoleküle in das Wirtsgewebe, die sogenannten Effektoren, die in der Lage sind pflanzenseitig die Immunität zu unterdrücken und den Metabolismus zu manipulieren. Mit Hilfe eines ROS – Burst Screens in dem Ustilago maydis Effektoren ohne Signalpeptid in Nicotiana benthamiana Pflanzen, produziert wurden, konnte eine Gruppe potenzieller Effektoren identifiziert werden, welche die Bildung von ROS unterdrücken. Dafür wurden 288 Ustilago maydis Effektoren getestet, wobei 34 verschiedene Effektoren eine ROS Akkumulation verhindern konnten.
Ziel dieser Studie war es vier dieser Effektorenkandidaten von Ustilago maydis, ROSIE1-4 (ROS-burst Inhibiting Effector 1-4) im Zusammenhang mit der Unterdrückung von ROS Bildung näher zu charakterisieren. Im ersten Schritt wurden zur Identifizierung möglicher interagierender Proteine, diese in Nicotiana benthamiana exprimiert. Potenziell interagierende Proteine wurden durch Massenspektrometrie nach einer Ko-immunpräzipitation identifiziert und davon wurden 21 für weitere Analysen ausgewählt. Um mehr über die Rolle dieser pflanzlichen Proteine in Bezug auf die PTI zu erfahren, wurden ihre Gene durch Virus-induziertes Gen-Silencing in Nicotiana benthamiana gesilenced und ihre transkriptionelle Stilllegung mit qPCR auch überprüft. Die jeweils in einem möglichen Zielgen stillgelegten Pflanzen wurden für ROS-burst assays mit PAMPs behandelt. Interessanterweise führte die transkriptionelle Reduktion bei 8 Genen zu einer signifikanten Zunahme bzw. Abnahme der ROS Aktivität nach PAMP Behandlung in der Pflanze. Dieses deutet darauf hin, dass sich die mit den ROS-burst interferierenden Effektoren im Komplex befindlichen Wirtsgene mögliche positive oder negative Regulatoren in der ROS-burst vermittelten pflanzlichen Abwehr sind.
Darüber hinaus lieferte ein subzellulärer Lokalisierungstest in Kombination mit ROS burst assays wichtige Informationen über den Ort ihrer Wirksamkeit innerhalb einer Zelle. Nach Flagellinbehandlung konnte beobachtet werden, dass ROSIE 1 bei der ektopischer Expression in verschiedene Zellkompartimente hochaktiv im Kern und im Zytosol ist, während ROSIE 4 seine stärkste Aktivität in der Plasmamembrane zeigte. Hierbei konnte auch gezeigt werden, dass ROSIE 2 und ROSIE 3 eine starke Unterdrückung von ROS in allen getesteten Zellkompartimenten aufweisen.
Ustilago maydis Deletions-Mutanten der entsprechenden Effektor Gene, zeigten keinen sichtbaren Virulenzdefekt. Allerdings konnte für ROSIE 1 eine leichte Abnahme der Gallenbildungsrate in der Pflanze festgestellt werden.
In dieser Masterarbeit konnten mehrere Pflanzenproteine identifizieren werden, die mit ROS-burst inhibierenden Effektoren interagieren und einen direkten positiven oder negativen Einfluss auf das Pflanzenabwehrsystem haben. Diese Ergebnisse werfen ein neues Licht auf mehrere verschiedene Pflanzenproteine und deren Involvierung in die ROS-burst vermittelte pflanzliche Abwehr.
Abstract
(Englisch)
Exploring the molecular mechanism how pathogens successfully colonize on their host plant is crucial for developing sustainable strategies to decrease crop yield losses. Fungal colonization on plants depends upon the ability to manipulate the immune defense response of the plant. Pattern recognition receptors (PRR) recognize molecules associated with the invading pathogen, so called pathogen associated molecule pattern (PAMP), which leads to activation of immune responses (PAMP-triggered immunity; PTI). One of the earliest observable aspects of plant defense, is the production of reactive oxygen species in the apoplast (ROS burst), generated by the NADPH oxidase. For pathogens to overcome this response, they secrete molecules, called effectors, which suppress local and systemic defense responses. ROS burst screening of Ustilago maydis effectors by heterologous expression in Nicotiana benthamiana revealed a group of putative effectors that show ROS burst inhibition. For this purpose, out of 288 Ustilago maydis effectors that were expressed without signalpeptide in Nicotiana benthamiana plants, 34 were identified to interfere with the plant defense by inhibiting ROS accumulation upon PAMP perception.
The main purpose of this study was to elucidate the mode of action of four identified Ustilago maydis effectors ROSIE1-4 (Ros-burst Inhibiting Effectors 1-4). To illuminate potential ways effectors mediate ROS burst inhibition, ROSIE 1-4 were transiently expressed in Nicotiana benthamiana plants without signalpeptide and with epitope tags. Potential interacting proteins were identified by mass spectrometry after co-immunoprecipitation. Comparative analysis of the MS data revealed 21 plant proteins that showed to be potentially specifically in the complex with one or more of the tested effector candidates. To gain more insight into their involvement in PTI, virus induced gene silencing of putative host targeted proteins were tested in Nicotiana benthamiana and the efficiency of silencing was verified by performing qPCR to monitor the decrease of gene expression. Interestingly, 8 potentially interacting proteins were showing a significantly increase or decrease of ROS activity upon PAMP treatment when silenced in plants, which suggest that they genetically behave as negative or positive regulators in PAMP-triggered immunity.
Furthermore, subcellular localization assays linked to ROS-burst assays provided important information about the place of action of observed ROSIE´s within the cell. Ectopic expression of the effectors fused to various mislocalisation tags, showed that ROSIE 1 is highly active in the nucleus and the cytosol, while ROSIE 4 acts likely at the cytosolic side of the plasma membrane upon PAMP perception in plants. In contrary, ROSIE 2 and ROSIE 3 demonstrate a strong suppression of ROS in all tested cellular compartments.
The U. maydis deletion strains of ROSIE 2 and ROSIE 3 genes did not show any visible virulence defect. A slight but not significant loss of gall formation was however observed for the deletion strain of ROSIE 1.
In summary, this master thesis demonstrates that several plant proteins that are potentially in a complex with ROS-burst inhibiting effectors, either having a positive or negative influence on PTI-signaling in plants adding novel players of the plant Immune network to the puzzle. Additionally, the results shed new light on how the biotrophic fungus U. maydis dampens PTI.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
Ustilago maydis Zea mays Pathogen triggered immunity ROS ROS burst
Schlagwörter
(Deutsch)
Ustilago maydis Zea mays Pathogen triggered immunity ROS ROS burst
Autor*innen
Indira Saado
Haupttitel (Englisch)
Functional elucidation of pathogen triggered immunity (PTI) inhibiting effectors of Ustilago maydis
Paralleltitel (Deutsch)
Funktionelle Charakterisierung von "Pathogen Triggered Immunity" (PTI)-inhibirenden Effektoren von Ustilago maydis
Publikationsjahr
2018
Umfangsangabe
x, 106 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Armin Djamei
AC Nummer
AC15216357
Utheses ID
48621
Studienkennzahl
UA | 066 | 877 | |