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Investigating the affinity of metalloporphyrin (TMPyP-AU) for deoxyribonucleic and ribonucleic poly-(A) motif and at-tempt to localization of viral poly-(A) within HRV capsid
Mahbod Mousavian
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Molekulare Mikrobiologie, Mikrobielle Ökologie und Immunbiologie
Betreuer*in
Dieter Blaas
DOI
10.25365/thesis.56931
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-17283.43585.438774-8
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Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Ziel dieser Forschung war es, die Voraussetzungen für die Lokalisierung von RNA-Sequenzmotiven, insbesondere des Poly (A) -Schwanzes innerhalb der genomischen Virus-RNA von Rhinoviren, zu schaffen, die entweder in der Proteinhülle des nativen Virus oder während der Virus-RNA verkapselt sind Austritt Es wurde gezeigt, dass Porphyrin-Metallderivate, insbesondere Porphyrin-Kupfer, eine hohe Affinität für Poly- (A) aufweisen. Andererseits argumentierten wir, dass Gold aufgrund seiner höheren Dichte mit EM leichter zu beobachten ist. Wasserlösliches Porphyrin (TMPyP) und verschiedene Porphyrin-Metallderivate können mit einem breiten Bereich von doppelsträngiger (ds) DNA, G-Quadruplex und anderen biologischen Makromolekülen interagieren. Der dsDNA-Bindungsmodus von Porphyrin und Metallporphyrinen weist auf eine Vielzahl von Bindungsmodi hin, wie partielle Interkalation, Furchenbindung und Bindung von außen mit Selbststapelung der Porphyrine.Wir erhielten den Gold-Porphyrin-Komplex, der dem Kupfer-Porphyrin äquivalent ist, und untersuchten dessen Spezifität und Affinität für Poly (A). Durch die Verwendung von Spektrophotometrie, Elektromigrationsverschiebungsassays (EMSA) und Kernspinresonanz (NMR) konnten wir zeigen, dass Gold-Porphyrin tatsächlich bevorzugt Poly (A) bindet und seine Affinität in einem ähnlichen Bereich wie für die Kupferverbindung liegen kann. Im Rahmen dieser Masterarbeit war es nicht möglich, den nächsten Schritt zu untersuchen, bei dem versucht wurde, das Poly- (A) im nativen Virus oder im durchlässigeren intermediären subviralen A-Partikel mithilfe von EM-Techniken zu lokalisieren.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
porphyrin HRV poly-(A) gelshift spectrometry
Schlagwörter
(Deutsch)
Porphyrin HRV Poly-(A) Gelverschiebung Spektrometrie
Autor*innen
Mahbod Mousavian
Haupttitel (Englisch)
Investigating the affinity of metalloporphyrin (TMPyP-AU) for deoxyribonucleic and ribonucleic poly-(A) motif and at-tempt to localization of viral poly-(A) within HRV capsid
Publikationsjahr
2019
Umfangsangabe
46 seiten : Diagramme
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Dieter Blaas
Klassifikation
44 Medizin > 44.43 Medizinische Mikrobiologie
AC Nummer
AC15355354
Utheses ID
50288
Studienkennzahl
UA | 066 | 830 | |