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The role of the zinc finger motif in topoisomerase 3 in Caenorhabditis elegans meiosis
Nina Vojtassáková
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Genetik und Entwicklungsbiologie
Betreuer*in
Verena Jantsch-Plunger
DOI
10.25365/thesis.63663
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-26862.56537.103665-3
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Crossovers, die während der meiotischen Reparatur von DNA- Doppelstrangbrüchen entstehen, sind nicht nur wichtig für den Austausch von genetischem Material, sondern reifen zu Chiasmen. Diese zeichnen sich durch physische Verbindungen zwischen homologen Chromosomen aus, die eine wesentliche Spannung für korrekte Chromosomensegregation erzeugen. Da die Anzahl der Doppelstrangbrüche die Menge der Crossovers überschreitet, stellt eine Vielfalt von Enzymen die Genomintegrität wieder her, indem sie die meisten Rekombinationsintermediate zu Noncrossovers reparieren. Mehrere Studien werfen ein neues Licht auf solche Enzyme, indem sie den BTR Komplex als „Chaperon“ einführen, das Rekombinationsintermediate auflöst, um zusätzliche homologe und heterologe Rekombination zu verhindern. Der Säuger BTR Komplex besteht aus Topoisomerase Typ IA (TOP-3 in Würmer), BLM Helikase (HIM-6) und den Gerüstproteinen RMI1/2 (RMH-1 und RMH-2). Depletion von Komplexmitgliedern verursacht letale Hyperrekombination und chromosomale Missegregation. Studien in meinem Hosting-Labor haben eine Beteiligung von rmh-1 an verschiedenen Komplexen gezeigt, die sowohl homologe Crossover- als auch Noncrossover Rekombination während der Meiose in C. elegans fördern. Im Rahmen meines Masterprojektes habe ich die Funktion von TOP-3 Zinkfinger (ZnF) Motiv in der meiotischen Prophase I in C. elegans untersucht. TOP-3 trägt eine katalytische Domäne und einen carboxyterminalen ZnF Motiv vom GRF-Typ, das mehr als 50% ihrer Sequenz mit Zinkfingern von Hs TOPIIIα teilt. Durch die Erzeugung einer verkürzten Version von TOP-3, dem das ZnF Motiv fehlt, konnte ich die Rolle des Motivs während mehrerer Schritte der meiotischen Rekombination analysieren.
Abstract
(Englisch)
Crossovers that occur during meiotic repair of DNA double strand-breaks (DSBs) are not only important for exchange of genetic material, but also establish chiasmata between homologous chromosomes that generate essential tension for the correct chromosome segregation. As the number of DSBs exceeds the number of crossovers, a variety of enzymes is required to repair most recombination intermediates to noncrossovers in order to restore genome integrity. Several studies shed new light on such enzymes by introducing the BTR complex as “chaperone” that resolves joint molecules at multiple recombination steps to prevent the occurrence of extra homologous and heterologous recombination intermediates. The mammalian BTR complex is composed of type IA topoisomerase (TOP-3 in worms), Bloom helicase (HIM-6) and RMI1/2 scaffolding proteins (RMH-1 and RMH-2). Depletion of the complex has been shown to cause lethal hyperrecombination and chromosomal missegregation. Studies in my hosting lab displayed an involvement of rmh-1 in distinct complexes that promote both crossover and noncrossover recombination during C. elegans meiosis. During my master thesis I have investigated the function of the TOP-3 zinc finger motif (ZnF) in meiotic prophase I of C. elegans. TOP-3 harbors a catalytic domain and a carboxyterminal ZnF domain that shares more than 50% of its sequence with zinc fingers found in Hs TOPIIIα. By generating the truncated version of TOP-3 which lacks the ZnF motif, I was able to analyze the role of the motif during multiple steps of meiotic recombination.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
Caenorhabditis elegans meiosis zinc-finger motif BTR complex recombination dissolution crossover recombination
Schlagwörter
(Deutsch)
Caenorhabditis elegans Topoisomerase 3 Zinkfingermotiv BTR Komplex Rekombination Meiose
Autor*innen
Nina Vojtassáková
Haupttitel (Englisch)
The role of the zinc finger motif in topoisomerase 3 in Caenorhabditis elegans meiosis
Paralleltitel (Deutsch)
Die Rolle des Zinkfingermotivs in der Topoisomerase 3 bei der Meiose von Caenorhabditis elegans
Publikationsjahr
2020
Umfangsangabe
111 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Verena Jantsch-Plunger
Klassifikation
42 Biologie > 42.20 Genetik
AC Nummer
AC15726998
Utheses ID
56478
Studienkennzahl
UA | 066 | 877 | |