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Analysis of the causality of protein - cardiac adverse drug reactions represented in the ADReCS data base
Halina Paulenka
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Pharmazie
Betreuer*in
Gerhard Ecker
DOI
10.25365/thesis.69797
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-11171.37929.132132-2
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Viele potenziellen Medikamente scheitern in klinischen Studien an schwerwiegenden unerwünschten Arzneimittelwirkungen (UAW). Diese UAWs werden in den meisten Fällen durch die Wechselwirkung von pharmakologisch aktiven Substanzen mit Zielproteinen im menschlichen Körper verursacht. Daher spielt die Vorhersage des toxischen Potenzials von Arzneimitteln im Stadium präklinischer Studien eine wichtige Rolle.
Ziel der Masterarbeit war es, die Kausalität zwischen Proteinen und unerwünschten Arzneimittelwirkungen, die in der ADReCS-Target-Datenbank gesammelt wurden, zu analysieren. Unter Verwendung der KNIME-Analyseplattform wurde ein ausgewählter Teil der ADReCS-Target-Datenbank durch Proteinnamen ergänzt. Nach solcher Optimierung wurde eine Gruppe von menschlichen Proteinen isoliert, die mit unerwünschten kardialen Wirkungen assoziiert sind. Zur Klassifizierung von UAWs wurden standardisierte medizinische Wörterbücher MedDRA und MeSH verwendet. Die isolierte Gruppe von ADR-Protein-Beziehungen wurde mit den Daten aus der DisGeNet-Datenbank verglichen. DisGeNet wurde als bekannte und verifizierte Datenbank zum Datenvergleich ausgewählt. Schließlich wurde der direkte Zusammenhang zwischen der Proteinfunktion und möglichen kardialen unerwünschten Wirkungen durch die Suche nach Informationen in wissenschaftlichen Veröffentlichungen bewertet.
Abstract
(Englisch)
A lot of potential drugs fail in clinical trials due to serious adverse reactions (ADRs). These ADRs are in most cases caused by the interaction of pharmacologically active substances with target proteins in the human body. Therefore, predicting the toxic potential of drugs plays an important role at the stage of preclinical trials.
The aim of the thesis was to analyze the causality between proteins and adverse drug reactions collected in the ADReCS-Target database. Using the KNIME analytical platform a selected part of the ADReCS-Target database was supplemented with protein names. After such optimization a group of human proteins associated with cardiac disorders was isolated. For classification of ADRs standardized medical dictionaries MedDRA and MeSH were used.
The isolated group of ADR-protein associations was compared with the data from DisGeNet database as a well-known and verified data bank. Finally, the direct connection between protein function and potential cardiac adverse effects was evaluated by searching for information in scientific publications.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
in silico toxicology adverse drug reactions cardiac disorders analytical platform the Knime databases enzyms receptors ion channels drug-target
Schlagwörter
(Deutsch)
in silico Toxikologie unerwünschte Arzneimittelwirkungen Herzerkrankungen Analyseplattform the Knime Datenbanken Enzyme Rezeptoren Ionenkanäle Drug-Target
Autor*innen
Halina Paulenka
Haupttitel (Englisch)
Analysis of the causality of protein - cardiac adverse drug reactions represented in the ADReCS data base
Paralleltitel (Deutsch)
Analyse der Kausalität von Protein - kardiale unerwünschte Arzneimittelwirkungen, die in der ADReCS-Datenbank dargestellt sind
Publikationsjahr
2021
Umfangsangabe
48 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Gerhard Ecker
Klassifikationen
44 Medizin > 44.42 Pharmazeutische Chemie ,
54 Informatik > 54.64 Datenbanken
AC Nummer
AC16341955
Utheses ID
60034
Studienkennzahl
UA | 066 | 605 | |