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Targeted metabolomics of biofluids and extracellular vesicles of ovarian cancer patients
Ines Muzaferovic
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Pharmazie
Betreuer*in
Franz Gabor
DOI
10.25365/thesis.72435
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-31007.47470.292263-9
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Eierstockkrebs ist die achthäufigste Krebserkrankung bei Frauen weltweit und im Vergleich zu anderen gynäkologischen Malignomen hat Eierstockkrebs die höchste Sterblichkeitsrate. Die Entwicklung von Aszites in der Peritonealhöhle ist mit einer schlechteren Prognose und einem aggressiveren Verlauf verbunden. Extrazelluläre Vesikel (EVs), die in den Aszitesflüssigkeiten produziert und sezerniert werden, werden für den interzellulären Crosstalk in der Mikroumgebung des Tumors (TME) verwendet. Da metabolische Veränderungen eines der „hallmarks of cancer“ darstellt und der Fokus bezüglich des Inhaltes der EVs nur auf Proteomik und Transkriptomik lag, ist es wichtig, das Metabolom von EVs zu untersuchen. Ziel dieser Arbeit war es, das metabolomische Profil von Bioflüssigkeiten wie Aszites und Peritonealspülungen von Eierstockkrebspatientinnen und den entsprechenden isolierten EVs zu erkennen und zu analysieren. Zu diesem Zweck wurde im Labor eine Methode unter Verwendung des AbsoluteIDQ® p180 Metabolomic Kits (Biocrates), gekoppelt mit einem LC/MS-System und FIA-Analyse, implementiert. Nach erfolgreicher Implementierung der Methode wurden 155 Metaboliten in den Aszitesflüssigkeiten und Peritonealspülungen identifiziert. Im Vergleich zu den Bioflüssigkeiten konnte eine geringere Anzahl von 69 Metaboliten aus den isolierten EVs der Aszitesflüssigkeit und 43 Metaboliten aus den isolierten EVs der Peritonealspülungen nachgewiesen werden. Multivariate Datenanalysen wie Principal Component Analysis und Hierarchical Clustering Analysis zeigen, dass keine signifikanten Unterschiede zwischen den Bioflüssigkeiten oder zwischen den EV-Gruppen gefunden werden konnte. Dennoch unterschied sich die metabolische Ausbeute der Bioflüssigkeiten signifikant von der der EVs hinsichtlich 1) der Metabolitenklassen und 2) der Quantität der Metaboliten. Nur in den Bioflüssigkeiten wurden Aminosäuren, biogene Amine und Acylcarnitine quantifiziert, während die EVs mit Lipiden wie Sphingomyelinen und Phosphatidylcholinen angereichert waren. Eine detailliertere Analyse könnte Patienteninformationen wie Alter, Behandlung und Rückfall einbeziehen, um Biomarker für die Diagnose, Prognose und eine zielgerichtetere Behandlung zu finden.
Abstract
(Englisch)
Ovarian cancer is the eighth most common female cancer worldwide and compared to other gynecologic malignancies, ovarian cancer has the highest mortality rate. The accumulation of ascitic fluids in the peritoneal cavity is associated with a worse prognosis and a more aggressive course. In addition, extracellular vesicles (EVs) circulating within the ascitic fluids, participate in the intercellular crosstalk in the tumour microenvironment. Since metabolic alteration is one of the hallmarks of cancer, and so far, studies of EVs have mostly focused on proteomics and transcriptomics, it is essential to study the metabolome of EVs. This work aimed to detect and analyse the metabolomic profile of biofluids, namely ascitic fluids and peritoneal washes, of ovarian cancer patients and of the corresponding isolated EVs. For this, a method with the use of the AbsoluteIDQ® p180 metabolomic kit (Biocrates), coupled with an LC-MS system and FIA analysis was implemented in the lab. After the successful implementation of the method, 155 metabolites were identified in the ascitic fluids and peritoneal washes. A smaller number of 69 metabolites could be detected in the EVs from ascitic fluids and 43 metabolites in EVs from the peritoneal washes. Multivariate data analysis such as principal component analysis and hierarchical clustering analysis shows that no significant differences between the two biofluids or between their EVs could be found. Nevertheless, the metabolic yield of the biofluids differed significantly from the EVs concerning 1) the metabolite classes and 2) the quantifications of metabolites. Only in the biofluids amino acids, biogenic amines and acylcarnitines were quantified, whereas the EVs were enriched in lipids such as sphingomyelins and phosphatidylcholines. A follow-up analysis could include patient information such as age, treatment, and relapse, to find biomarkers for diagnosis, prognosis, and support more targeted treatment.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
gerichtete Metabolomik Eierstockkrebs Aszites Extrazelluläre Vesikel
Schlagwörter
(Englisch)
targeted metabolomics ovarian cancer ascites extracellular vesicles
Autor*innen
Ines Muzaferovic
Haupttitel (Englisch)
Targeted metabolomics of biofluids and extracellular vesicles of ovarian cancer patients
Paralleltitel (Deutsch)
Gerichtete Metabolomik von Bioflüssigkeiten und extrazellulären Vesikeln von Patientinnen mit Eierstockkrebs
Publikationsjahr
2022
Umfangsangabe
79 Seiten : Illustrationen
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Franz Gabor
Klassifikation
44 Medizin > 44.99 Medizin: Sonstiges
AC Nummer
AC16648933
Utheses ID
64562
Studienkennzahl
UA | 066 | 605 | |