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Evaluation of "rep" and ORF49 of φCh1
regulation of gene expression in dependence of growth conditions
Julian Szalay
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Molecular Microbiology, Microbial Ecology and Immunobiology
Betreuer*in
Angela Witte
DOI
10.25365/thesis.72893
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-18781.27253.384462-4
Link zu u:search
(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
φCh1-1 ist eine natürlich auftretende Mutante des temperaten Halovirus φCh1, die eine Duplikation im ORF49 besitzt. Es wird angenommen, dass der offene Leserahmen ORF49 für einen Transkriptionsfaktor kodiert, der für die Verstärkung der Expression von Genen verantwortlich ist, die für das Einsetzen und Beibehalten der Lyse zuständig sind. Studien über ORF49´, also den partiell duplizierten ORF49, erlauben tiefere Einblicke in den molekularen Schalter zwischen lysogenen und lytischen Lebenszyklus von φCh1. Um die Frage zu beantworten ob ORF49´ tatsächlich in das Protein gp49´ translatiert wird, welches möglicherweise einen Einfluss auf das Lyse Verhalten von φCh1 hat, wurde das Start Codon in ORF49´ mittels Clonierung entfernt und der so veränderte ORF49/ORF49´ΔAUG auf low und high copy Plasmiden in verschiedene N. magadii L11 Kulturen transformiert und exprimiert. Schließlich wurde das Lyse Verhalten der resultierenden Kulturen mit Hilfe von Wachstumskurven, Western blots und Virus Titer Analysen verfolgt, Diese Evaluierungen zeigten klar, dass Kulturen in denen ORF49´ exprimiert wurde ein supprimiertes Lyse Verhalten aufgewiesen haben, wohingegen die meisten Kulturen, die das gelöschte Start Codon in ORF49 beinhaltet haben, ein normales Lyse Verhalten zeigten. Diese Beobachtungen lassen darauf schließen, dass ORF49´ tatsächlich als das verkürzte Protein gp49´ exprimiert wird, das einen die Lyse abschwächenden Effekt aufweist. Ob der Wirkungsmechanismus dieses Effekts wirklich darauf beruht, dass zwar eine DNA binding Domäne, aber keine trans-acting Domäne in gp49´ vorhanden ist, und dieser Umstand dazu führt, dass die Bindungsstellen für gp49 durch gp49´ blockiert sind jedoch gp49´ nicht mit der RNA Polymerase kommunizieren kann, was zu ineffizienter Expression von lytischen Genen führt, müssen weitere Studien klären.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
temperate virus halo-virus gene regulation
Autor*innen
Julian Szalay
Haupttitel (Englisch)
Evaluation of "rep" and ORF49 of φCh1
Hauptuntertitel (Englisch)
regulation of gene expression in dependence of growth conditions
Publikationsjahr
2022
Umfangsangabe
104 Seiten : Illustrationen
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Angela Witte
Klassifikation
42 Biologie > 42.13 Molekularbiologie
AC Nummer
AC16733520
Utheses ID
65654
Studienkennzahl
UA | 066 | 830 | |