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Integrative taxonomy and DNA barcoding of Austrian freshwater turbellarians
Matthäus Greilhuber
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Zoologie
Betreuer*in
Elisabeth Haring
DOI
10.25365/thesis.74584
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-27514.05880.761161-5
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Die vorliegende Studie befasst sich mit DNA-Barcoding von Süßwasserturbellarien in Österreich. Sequenzen der 18S- und 28S-rRNA-Gene wurden als DNA-Barcodes verwendet. Die Turbellarien (Platyhelminthes exklusive Neodermata) sind ein wichtiger, aber wenig erforschter Bestandteil von Süßwasserökosystemen. Durch das Verbinden von morphologischen mit molekulargenetischen Daten kann DNA-Barcoding dazu beitragen, den erheblichen Mangel an Kenntnis über die Biodiversität dieser Organismengruppe zu überwinden. Die vorliegende Studie trägt zum Erreichen dieses Ziels bei, indem neue DNA-Barcode-Sequenzen der 18S- und 28S-rRNA-Gene einer Reihe von Süßwasserturbellarien generiert wurden, wovon einige Taxa zum ersten Mal sequenziert wurden (z. B. Mesostoma craci und Opistomum pallidum). Hundertvierundfünfzig in Ostösterreich gesammelte Exemplare wurden mittels Mikroskopie lebender Tiere, histologischer Serienschnitte und der 18S- und 28S-rRNA-Gen-Sequenzen analysiert. Zweiundvierzig niedere Plattwurm-Taxa (auf das niedrigst mögliche taxonomische Niveau bestimmt) wurden im Untersuchungsgebiet nachgewiesen. Zusätzlich wurde eine Art der Xenacoelomorpha (Oligochoerus limnophilus) gefunden. Durch die Durchführung einer Genitalrekonstruktion eines Turbellarien-Exemplars konnte dieses als Polycelis tenuis bestimmt werden. Bei 104 Exemplaren konnte zumindest eines der Marker-Gene erfolgreich sequenziert werden. Die so erlangten Sequenzen wurden mittels Maximum-Likelihood (ML) - Bäumen phylogenetisch analysiert und gemeinsam mit Sequenzen aus der Datenbank GenBank in Neighbor-Joining (NJ) - Bäume eingebettet, um die genetischen Distanzen zu illustrieren. Die ML- und NJ-Bäume ergaben, dass alle enthaltenen Gattungen außer Castrada monophyletisch sind. Die Gensequenzen bestätigten im Allgemeinen die auf Morphologie basierenden Bestimmungen, wenn auch nicht in allen Fällen Referenzsequenzen vorhanden waren.
Abstract
(Englisch)
The present study deals with DNA barcoding of freshwater turbellarians in Austria. As DNA barcodes, 18S and 28S rRNA gene sequences were generated. The turbellarians (Platyhelminthes excluding Neodermata) are an essential, but poorly known component of freshwater ecosystems. By connecting morphological data to DNA sequence data, the severe lack of knowledge on the biodiversity of this organismal group can be overcome. The present study contributes to this goal by establishing new DNA sequences of the 18S and 28S rRNA genes of a number of freshwater turbellarian species, of which several are sequenced for the first time (e. g., Mesostoma craci and Opistomum pallidum). I analyzed 154 specimens collected in Eastern Austria using various methods: microscopy of living specimens, histological serial sections, and the DNA sequence analysis of sections of the 18S and 28S rRNA genes. Fourty-two low-level flatworm taxa (determined by morphology to the lowest level possible) were found in the study area. In addition, one species of Xenacoelomorpha (Oligochoerus limnophilus) was found. The genital reconstruction of one turbellarian specimen from histological serial sections allowed its identification as Polycelis tenuis. In 104 specimens, at least one marker gene was sequenced successfully. The sequences obtained were analyzed in maximum likelihood (ML) phylogenetic trees and embedded in neighbor-joining (NJ) trees together with published sequences from the GenBank database to illustrate the genetic distances. The ML and NJ trees revealed all genera in the material except Castrada as monophyletic. The genetic sequences generally confirmed the identifications based on morphology, but reference sequences of the same species are not always available.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
Turbellaria freilebende Plattwürmer Meiofauna Turbellarien Mesofauna
Schlagwörter
(Englisch)
Turbellaria free-living flatworms meiofauna mesofauna
Autor*innen
Matthäus Greilhuber
Haupttitel (Englisch)
Integrative taxonomy and DNA barcoding of Austrian freshwater turbellarians
Paralleltitel (Deutsch)
Integrative Taxonomie und DNA-Barcoding österreichischer Turbellarien
Publikationsjahr
2023
Umfangsangabe
73 Seiten : Illustrationen
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Elisabeth Haring
AC Nummer
AC16977948
Utheses ID
68857
Studienkennzahl
UA | 066 | 831 | |