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Sortendifferenzierung von Sonnenblumen und Weinreben mittels hochauflösender Schmelzkurvenanalyse
Jakob Scheibelreiter
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Chemie
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Lebensmittelchemie
Betreuer*in
Margit Cichna-Markl
DOI
10.25365/thesis.76218
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-19797.91955.295932-6
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Lebensmittelbetrug, bei dem durch absichtliche Täuschung ein finanzieller oder wirtschaftlicher Vorteil durch die Bereitstellung falscher Informationen über die Herkunft, Qualität und Zusammensetzung von Lebensmitteln erlangt werden soll, stellt ein globales Problem dar. Diese Masterarbeit untersuchte, ob ausgewählte Mikrosatelliten (SSR) geeignet sind, um Sonnenblumensorten zu differenzieren, einschließlich der in der österreichischen Sortenliste angeführten Sorten, sowie mazedonische Weinsorten. Die angewandte Methode umfasst eine Polymerasekettenreaktion (PCR), bei der die Mikrosatelliten amplifiziert wurden. Anschließend erfolgt eine Hochauflösende Schmelzkurvenanalyse (HRM), bei der die Amplicons mittels eines Temperaturgradienten denaturiert werden. Dies ermöglicht die Erzeugung unterschiedlicher Schmelzkurven basierend auf der Basenabfolge und somit die Unterscheidung der Sorten. Für die Unterscheidung der Sonnenblumensorten wurden 19 Primerpaare aus der Literatur praktisch getestet und gegebenenfalls die Anlagerungstemperatur optimiert. Als Proben dienten Sonnenblumensamen von 44 verschiedenen Sorten, bereitgestellt von der AGES und der Saatgut Austria. Die DNA-Extraktion erfolgte mit Hilfe eines kommerziellen Kits. Eine Duplex-Reaktion aus 2 Primerpaaren lieferte die beste Diskriminierung der Sorten. Für die vollständige Unterscheidung der gelisteten Referenzsorten mussten zusätzlich jedoch noch 3 weitere Primerpaare eingesetzt werden. Für die Unterscheidung der mazedonischen Weinsorten wurden 9 Primerpaare, welche auch in der Datenbank von Vitis International Variety Catalogue (VIVC) verwendet werden, getestet und die PCR Bedingungen optimiert. Weinblätter von 11 verschiedenen mazedonischen Weinsorten wurden als Proben verwendet, und aus diesen die DNA extrahiert. Alle 11 Sorten konnten mit der Primerkombination VVS2xVrZAG79 diskriminiert werden. Insbesondere konnte Vranec, der als König der mazedonischen Weine gilt, zuverlässig von den anderen Sorten mit 4 der 9 getesteten Primerpaare unterschieden werden.
Abstract
(Englisch)
Food fraud, which involves deliberate deception to gain a financial or economic advantage by providing false information about the origin, quality and composition of food, is a global problem. This master thesis investigated whether selected simple sequence repeats (SSR) are suitable to differentiate sunflower varieties, including those listed in the Austrian variety list, as well as Macedonian wine varieties. The method used involves a polymerase chain reaction (PCR) in which the SSRs were amplified. This is followed by high-resolution melting curve analysis (HRM), in which the amplicons are denatured using a temperature gradient. This enables the generation of different melting curves based on the base sequence and thus the differentiation of the varieties. For the differentiation of sunflower varieties, 19 primer pairs from the literature were tested in practice and, if necessary, the annealing temperature was optimized. Sunflower seeds of 44 different varieties, provided by AGES and Saatgut Austria, were used as samples. DNA extraction was carried out using a commercial kit. A duplex reaction of 2 primer pairs provided the best discrimination of the varieties. For the complete discrimination of the listed reference varieties, however, 3 additional primer pairs had to be used. For the differentiation of Macedonian wine varieties, 9 primer pairs, which are also used in the database of Vitis International Variety Catalogue (VIVC), were tested and the PCR conditions were optimized. Grape leaves from 11 different Macedonian wine varieties were used as samples and DNA was extracted from them. All 11 varieties could be discriminated with the primer combination VVS2xVrZAG79. In particular, Vranec, which is considered the king of Macedonian wines, could be reliably distinguished from the other varieties by 4 of the 9 primer pairs tested.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
Analytische Chemie Lebensmittelchemie PCR-HRM PCR Differenzierung von Sonnenblumensorten Differenzierung von mazedonischen Rebsorten Vranec Hochauflösende Schmelzkurvenanalyse
Autor*innen
Jakob Scheibelreiter
Haupttitel (Deutsch)
Sortendifferenzierung von Sonnenblumen und Weinreben mittels hochauflösender Schmelzkurvenanalyse
Paralleltitel (Englisch)
Varietal differentiation of sunflowers and grapevines using high-resolution melting curve analysis
Publikationsjahr
2024
Umfangsangabe
107 Seiten : Illustrationen
Sprache
Deutsch
Beurteiler*in
Margit Cichna-Markl
Klassifikationen
35 Chemie > 35.39 Analytische Chemie. Sonstiges ,
35 Chemie > 35.70 Biochemie. Allgemeines
AC Nummer
AC17237974
Utheses ID
71794
Studienkennzahl
UA | 066 | 659 | |