Detailansicht
GATA transcription factors function through GATC motifs in transcribed regions of plants
Gabriela Hristova
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Molecular Microbiology, Microbial Ecology and Immunobiology
Betreuer*in
Magnus Nordborg
DOI
10.25365/thesis.76501
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-28868.18053.298098-9
Link zu u:search
(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Frühere Arbeiten in meinem Gastlabor identifizierten ein 8-bp GATC-haltiges Motiv downstream der Transkriptionsstartstelle (TSS), das die Transkription stark fördert. Veröffentlichte Literatur legt nahe, dass die GATA-Familie von Transkriptionsfaktoren (TFs) die wahrscheinlichsten upstream-Regulatoren dieses Motivs sind. Diese Masterarbeit zielt darauf ab zu untersuchen, ob GATA-Faktoren die Transkription von Genen über das GATC-Motiv steuern, und zwar durch zwei Ansätze: den Abbau von GATA-Faktoren mittels eines parasitären Effektorproteins SAP05 und die Überexpressionsanalyse spezifischer GATA-Faktoren in Arabidopsis. Die Ergebnisse des ersten Ansatzes stützten unsere Hypothese, wenn auch mit einer bescheidenen Wirkung. Im Gegensatz dazu lieferte der zweite Ansatz starke Beweise dafür, dass GATC-haltige Gene direkte Ziele der Klasse-A-GATA-TFs sind. Zusammenfassend weisen diese Ergebnisse darauf hin, dass GATA-TFs die Genexpression über ein GATC-Motiv regulieren, das downstream der TSS liegt.
Abstract
(Englisch)
Previous work in my host lab identified an 8-bp GATC-containing motif downstream of the transcription start site (TSS) that strongly enhances transcription. Published literature suggests that the GATA family of transcription factors (TFs) are the most likely upstream regulators of this motif. This Master's thesis aims to investigate whether GATA factors control the transcription of genes through the GATC motif, employing two approaches: first, through the degradation of GATA factors via SAP05, a parasitic effector protein, and second, by overexpression of GATA TFs in Arabidopsis. The results from the first approach supported our hypothesis, albeit with a modest effect. Conversely, the second approach provided direct evidence that GATC-containing genes are targets of GATA TFs from class A. In summary, these findings indicate that GATA TFs regulate gene expression through a GATC motif located downstream of the TSS.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
GATC-Motiv Transkription GATA-Familie SAP05 Überexpressionsanalyse Genexpression Pflanzengenetik Arabidopsis
Schlagwörter
(Englisch)
transcription factors TFs GATA TFs GATC plants Arabidopsis thaliana gene expression transcription genetics SAP05 overexpression protoplasts
Autor*innen
Gabriela Hristova
Haupttitel (Englisch)
GATA transcription factors function through GATC motifs in transcribed regions of plants
Publikationsjahr
2024
Umfangsangabe
45 Seiten : Illustrationen
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Magnus Nordborg
AC Nummer
AC17284745
Utheses ID
72523
Studienkennzahl
UA | 066 | 830 | |