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Analysis of COnjugation Induced (COI) genes in Tetrahymena thermophila
Lucia Aronica
Art der Arbeit
Dissertation
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Betreuer*in
Kazufumi Mochizuki
DOI
10.25365/thesis.8232
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-30483.51657.975069-0
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Abstracts
Abstract
(Deutsch)
In Tetrahymena thermophila kommt es zu programmierter Eliminierung bestimmter DNA Sequenzen waehrend der sexuellen Reproduktion (Konjugation).
Ziel dieser Arbeit war es, Gene zu identifizieren, die an der DNA Eliminierung beteiligt sind. 22 konjugations-spezifische Gene (COI Gene) konnten als potenzielle Kandidaten identifiziert werden.
Im Verlauf dieser Arbeit wurde COI12, das eine spezifische Expression waehrend der Konjugation zeigt und notwendig ist fuer die Produktion lebensfaehiger Nachkommen, genauer analysiert. COI12 ist essentiell fuer die Eliminierung von DNA und agiert nach dem Export der scnRNA aus dem Mic in das Zytoplasma und vor dem Beladen des Argonaut Proteins Twi1p mit scnRNA. Ausserdem ist eine Primer-abhaengige RNA-abhaengige RNA Polymerase- (RdRP) Aktivitaet mit dem Protein Coi12p assoziiert. Coi12p interagiert mit zwei Proteinen, die Homologie zu bekannten RdRP Faktoren aufzeigen, Rdn3p and Rdf3p, und mit dem Dicer Protein Dcr1p. Moeglicherweise wird durch den mit Coi12p assoziierten RDRC dsRNA produziert, die von Dcr1p in sekundaere scnRNA prozessiert wird. Diese neue Klasse von scnRNA koennte spezifisch in Twi1p geladen werden und als epigenetischer Faktor im Prozess der DNA Eliminierung dienen.
Abstract
(Englisch)
Tetrahymena thermophila, like other ciliates, carries out programmed DNA elimination during sexual reproduction (conjugation).
Aim of this project was to identify novel genes involved in DNA elimination. Twenty-two conjugation specific genes (COI genes) have been identified as candidate gene with a possible role in DNA elimination.
In this study, I identified a COnjugation Induced (COI) gene, COI12, which is specifically expressed during conjugation and required for producing viable sexual progeny. I showed that COI12 is essential for DNA elimination and acts downstream scnRNA export from the Mic to the cytoplasm and upstream scnRNA loading into the Argonaute Twi1p. Moreover, Coi12p is associated to a primer-dependent RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) activity and interacts with two proteins related to RdRP factors, Rdn3p and Rdf3p, as well as with the Dicer Dcr1p.
Possibly, Coi12p-associated RDRC produces dsRNA that are processed by Dcr1p into a second class of scnRNA, secondary scnRNA, which is specifically loaded into Twi1p and act as epigenetic messenger in DNA elimination.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
DNA elimination RNA interference
Schlagwörter
(Deutsch)
DNA Eliminierung RNA Interferenz
Autor*innen
Lucia Aronica
Haupttitel (Englisch)
Analysis of COnjugation Induced (COI) genes in Tetrahymena thermophila
Paralleltitel (Deutsch)
Analyse konjugation-induzierter Gene in Tetrahymena thermophila
Publikationsjahr
2010
Umfangsangabe
78 S. : Ill., graph. Darst.
Sprache
Englisch
Beurteiler*innen
Leonie Ringrose ,
Martin Gorovsky
Klassifikationen
30 Naturwissenschaften allgemein > 30.00 Naturwissenschaften allgemein: Allgemeines ,
42 Biologie > 42.13 Molekularbiologie
AC Nummer
AC07958329
Utheses ID
7419
Studienkennzahl
UA | 091 | 490 | |