Detailansicht
Chromosome configuration, segregation, and ploidy in the euryarchaea Methanobrevibacter smithii and Methanopyrus kandleri
Andrew Yang King
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Molecular Biology
Betreuer*in
Simon Karl-Maria Rasso Rittmann
Mitbetreuer*in
Nika Pende
DOI
10.25365/thesis.78611
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-25816.16696.227927-6
Link zu u:search
(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Mit zunehmender Forschung an Archaeen, seit ihrer Klassifizierung als eigene Domäne im Jahr 1990, haben sich zahlreiche neue wissenschaftliche Möglichkeiten eröffnet. Im Zuge der Suche nach Lösungen zur Bekämpfung des Klimawandels rücken methanogene Archaeen zunehmend in den Fokus der Forschung. Diese Arbeit untersucht die Chromosomenbiologie zweier nicht-modellhafter methanogener Spezies, Methanobrevibacter smithii und Methanopyrus kandleri, mit besonderem Augenmerk auf Chromosomenkonfiguration, -segregation und Ploidie. Dabei kamen mehrere moderne Methoden zum Einsatz, darunter Direct-geneFISH, RASER-FISH, qPCR, GC-Skew-Analyse und Markerfrequenzanalyse (MFA). Es konnte gezeigt werden, dass das Chromosom von M. smithii monoploid ist, womit es das erste bekannte monoploide Mitglied der Euryarchaeota darstellt. Vorläufige Ergebnisse deuten darauf hin, dass M. kandleri polyploid sein könnte, obwohl die genaue Chromosomenkonfiguration und -segregation noch nicht bestimmt werden konnten. Diese Erkenntnisse tragen zu einem tieferen Verständnis der genomischen Organisation von Archaeen bei und könnten weiterführende Studien zur mikrobiellen Evolution und Anpassung unterstützen.
Abstract
(Englisch)
The expansion of research on archaea, since its classification into its own domain in 1990, has created many new research opportunities. As we continue to find ways to combat climate change, methanogenic archaea have become of particular interest to researchers. This thesis investigates the chromosome biology of two non-model methanogen species, Methanobrevibacter smithii and Methanopyrus kandleri, focusing on chromosome configuration, segregation, and ploidy. Several state-of-the-art methods were used including Direct-geneFISH, RASER-FISH, qPCR, GC skew analysis, and marker frequency analysis (MFA). The chromosome of M. smithii was found to be monoploid, making it the first known monoploid among the Euryarchaeota. Preliminary results suggest that M. kandleri may be polyploid, although its chromosome configuration and segregation remain to be determined. These findings contribute to a deeper understanding of archaeal genome organization and may inform broader studies of microbial evolution and adaptation.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
Chromosomenbiologie Ploidie Direct-geneFISH RASER-FISH qPCR Chromosomensegregation Archaea
Schlagwörter
(Englisch)
Chromosome Biology Ploidy Direct-geneFISH RASER-FISH qPCR Chromosome Segregation Archaea
Autor*innen
Andrew Yang King
Haupttitel (Englisch)
Chromosome configuration, segregation, and ploidy in the euryarchaea Methanobrevibacter smithii and Methanopyrus kandleri
Paralleltitel (Deutsch)
Chromosomenkonfiguration, -segregation und Ploidie bei den Euryarchaea Methanobrevibacter smithii und Methanopyrus kandleri
Publikationsjahr
2025
Umfangsangabe
53 Seiten : Illustrationen
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Simon Karl-Maria Rasso Rittmann
Klassifikation
30 Naturwissenschaften allgemein > 30.00 Naturwissenschaften allgemein. Allgemeines
AC Nummer
AC17563339
Utheses ID
76366
Studienkennzahl
UA | 066 | 865 | |