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The invasive amphibian fungus Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) in Vienna
biomonitoring using environmental DNA
Denise Dick-Disacke
Art der Arbeit
Masterarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Masterstudium Zoologie
Betreuer*in
Günter Gollmann
DOI
10.25365/thesis.79930
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-17243.19036.984729-7
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Es gibt viele Gründe für den weltweiten Rückgang der Amphibien seit den 1950er Jahren, wie den Verlust natürlicher Lebensräume, den Klimawandel oder Umweltverschmutzung. Eine der verheerendsten Ursachen ist der pathogene, aquatische Pilz Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), der für die weltweite Krankheit Chytridiomykose bei Amphibien verantwortlich ist. In Österreich wurden infizierte Exemplare in allen neun Bundesländern nachgewiesen. Zum Beispiel wurde der Pilz im Jahr 2011 in fünf von sieben Probenstellen in Wien festgestellt. Eine Massensterblichkeit, die durch Bd in Wien verursacht wurde, gab es noch nicht, jedoch ist die Anzahl der positiv getesteten Tiere alarmierend. Eine weitere Beobachtung der Pilzverbreitung ist notwendig. Diese Studie überprüfte die Anwendbarkeit der Umwelt-DNA-Methode (eDNA) für ein Monitoring von Bd und gab einen aktuellen Überblick über die Infektionssituation in Wien. Wasserproben wurden über einen Zeitraum von zwei Monaten aus zehn Gewässern in Wien entnommen. Die DNA der Wasserproben wurde extrahiert, gereinigt und mittels Real-Time-PCR-Methode analysiert. Zusätzlich wurden Hautabstriche von Amphibien aus der Umgebung der getesteten Teiche entnommen, und Bd-positive Exemplare aus dem Tiergarten Schönbrunn dienten als Positivkontrolle. Alle Hautabstriche und Wasserproben wurden Bd-negativ getestet. Es gibt einige pilzlimitierende Faktoren, wie zum Beispiel eine Temperatur über 25°C, das Amphibien-Hautmikrobiom, oder die Tatsache, dass einige Arten von Plankton Bd fressen. Die Belastung durch den Chytrid-Pilz auf Amphibienarten variiert von Zeit zu Zeit, weshalb es sehr wichtig ist, regelmäßig einen Überblick über seine Ausbreitung zu haben.
Abstract
(Englisch)
There are many reasons for the worldwide amphibian decline since the 1950s such as loss of natural habitats, climate change or environmental pollution. One of the most devastating causes is the pathogenic, aquatic zoosporic fungus Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), which is responsible for the global disease chytridiomycosis in amphibians. In Austria infected specimens were detected in all nine provinces. For example, in Vienna the fungus was detected in five of seven sampled sites in the year 2011. There was still no mass mortality provoked by Bd in Vienna, but the quantity of Bd positive tested animals is alarming. Further observation of the fungus distribution is necessary. This study examined the applicability of the Environmental DNA method for a monitoring of Bd and investigated the actual infection situation in Vienna. Water samples were collected from ten water bodies in Vienna over a period of two months. DNA of the water samples was extracted, purified and analyzed by Real Time PCR methods. Additionally, skin swabs were taken from amphibians around or in the tested ponds and Bd positive specimens from the Vienna Zoo were included as positive control. All the skin swabs and all water samples were tested Bd negative. Fortunately, there are a few fungus-limiting factors such as, for example, a temperature over 25°C, or the amphibian skin microbiome, or the fact that some planktonic predators feed on Bd. The load with the chytrid-fungus on amphibian species varies from time to time, so it is very important to survey its distribution regularly.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
Amphibien eDNA Batrachochytrium dendrobatidis Chytridiomykose
Schlagwörter
(Englisch)
Amphibian eDNA Batrachochytrium dendrobatidis chytridiomycosis
Autor*innen
Denise Dick-Disacke
Haupttitel (Englisch)
The invasive amphibian fungus Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) in Vienna
Hauptuntertitel (Englisch)
biomonitoring using environmental DNA
Publikationsjahr
2025
Umfangsangabe
82 Seiten : Illustrationen
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Günter Gollmann
Klassifikation
42 Biologie > 42.82 Amphibia. Reptilia
AC Nummer
AC17735736
Utheses ID
78555
Studienkennzahl
UA | 066 | 831 | |