Detailansicht
Genomic insights on the Maniq
population genetics, natural selection and immunogenetics
Tobias Herzog
Art der Arbeit
Dissertation
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Studiumsbezeichnung bzw. Universitätlehrgang (ULG)
Doctor of Philosophy-Doktoratsstudium Naturwissenschaften (Lebenswissenschaften): Biologie
Betreuer*innen
Martin Fieder ,
Helmut Schaschl
DOI
10.25365/thesis.81134
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-10813.88232.769334-1
Link zu u:search
(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Die Maniq im Süden Thailands sind eine der letzten noch existierenden Jäger- und Sammlergemeinschaften der Welt, jedoch ist unser Wissen über ihre Genomik noch sehr gering. Diese Dissertation präsentiert neue Erkenntnisse über ihre Evolutionsgeschichte, Populationsgenetik, gene-tischen Anpassungen und Immunogenetik. Unsere Analysen zeigen, dass die Maniq nah mit den Semang Gruppen Malaysias verwandt sind, die insgesamt als eine Mischung aus Andamanesen und Ostasiaten modelliert werden können. Die Maniq weisen im Vergleich zu anderen Semang die höchsten Werte für andamanische Abstammung auf und zeigen Anzeichen Vermischung in jüngerer Zeit mit ostasiatischer Abstammung. Die Maniq weisen einen der höchsten Grade an genetischer Differenzierung unter den lebenden menschlichen Populationen auf, was auf ihre geringe Populationsgröße und ihre historische Praxis der Endogamie hindeutet. Ihre Isolation zeigt sich auch in ihrer vergleichsweisen geringen HLA-Vielfalt, wobei nur wenige Allele mit höherer Häufigkeit vorkommen. Wir untersuchten direktionale und stabilisierende Selektion bei den Maniq und fanden Hinweise auf Anpassungen an Lebensstil und Umwelt. Die Anpassung an den Regenwald umfasst angereicherte Signalwege in der extrazellulären Matrixorganisation und Kollagensynthese, die mit struktureller Unterstützung und Mobilität in Verbindung stehen, sowie direktionale Selektion, die auf den adrenergen Signalweg in Kardiomyozyten wirkt, wahrscheinlich um die Stressresistenz und körperliche Leistungsfähigkeit zu erhöhen. Stabilisierende Selektion wurde vor allem in Genen mit Immunbezug festgestellt, insbesondere innerhalb der HLA-Region, was die entscheidende Rolle der genetischen Vielfalt für das Überleben in patho-genreichen Umgebungen unterstreicht. Interessanterweise standen insbesondere Regionen, die mit der Reaktion auf das Hepatitis-B-Virus in Verbindung stehen, unter Selektion, was möglicherweise zur jüngeren HLA-Evolution bei den Maniq beigetragen hat. Diese Dissertation liefert eine umfassende genomische Analyse der Maniq.
Abstract
(Englisch)
The Maniq of southern Thailand are one of the last remaining practicing hunter-gatherer com-munities in the world, yet our knowledge of their genomics is largely limited. This thesis presents novel insights into their evolutionary history, population genetics, genetic adaptations, and im-munogenetics. Our analyses reveal the Maniq to be closely related to the Semang populations of Malaysia, who altogether can be modelled as an ancestry mixture of Andamanese and East Asians. The Maniq exhibit the highest values of Andamanese-related ancestry when compared with other Semang and show signs of more recent admixture with East Asian-related ancestry. The Maniq exhibit one of the highest levels of genetic differentiation found among living human populations, indicative of their small population size and historical practice of endogamy. Their isolation is also apparent in their comparatively low HLA diversity, with only a few alleles occurring at higher frequencies. We investigated positive and balancing selection in the Maniq and found evidence pointing towards adaptations to their lifestyle and environment. Adaptation to a rainforest environment includes enriched pathways in extracellular matrix organization and col-lagen synthesis, which are linked to structural support and mobility, as well as positive selection acting upon adrenergic signaling in cardiomyocytes pathway, probably to increase stress resili-ence and physical performance. Balancing selection was primarily detected in immune-related genes, particularly within the HLA region, underscoring the critical role of genetic diversity in surviving pathogen-rich environments. Interestingly, especially regions associated with responses to hepatitis B virus were under selection, which may have contributed to recent HLA evolution in the Maniq. This thesis provides a comprehensive genomic analysis of the Maniq.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Deutsch)
Maniq Jäger-Sammler Humangenetik Selektion Immunogenetik
Schlagwörter
(Englisch)
Maniq Hunter-gatherer Human genetics Selection Immunogenetics
Autor*innen
Tobias Herzog 
Haupttitel (Englisch)
Genomic insights on the Maniq
Hauptuntertitel (Englisch)
population genetics, natural selection and immunogenetics
Paralleltitel (Deutsch)
Genomische Erkenntnisse über die Maniq
Paralleluntertitel (Deutsch)
Populationsgenetik, natürliche Selektion und Immunogenetik
Publikationsjahr
2026
Umfangsangabe
92 Seiten : Illustrationen
Sprache
Englisch
Beurteiler*innen
Karima Fadhlaoui ep Zid ,
Simon Goodman
AC Nummer
AC17890407
Utheses ID
79538
Studienkennzahl
UA | 794 | 685 | 437 |