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The search for novel mRNAs targeted by the RNA-destabilizing protein tristetraprolin for degradation
Christian Machacek
Art der Arbeit
Diplomarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Betreuer*in
Pavel Kovarik
DOI
10.25365/thesis.10357
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-30192.63236.651553-8
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Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Genexpression ist auf den Ebenen der Transkription, mRNA Stabilität und Translation reguliert. Die Stabilität der mRNA wird in den meisten Fällen von regulatorischen Elementen, welche sich in der 3´ untranslatierten Region der mRNA befinden, reguliert. Die am besten charakterisierten Elemente sind die sogenannten Adenin-Uridin-reichen Elemente (ARE). AREs werden von RNA-bindenden Proteinen erkannt, welche stabilisierende oder destabilisierende Effekte bewirken können. Eines dieser Proteine ist Tristetraprolin (TTP), welches dafür bekannt ist Entzündungsreaktionen durch die Beschleunigung von Cytokin mRNA Abbau zu unterdrücken. In dieser Arbeit beschreiben wir drei neue mRNAs wessen Abbau von TTP reguliert wird. Durch Untersuchung von primären Makrophagen und Reporter Systemen zeigen wir, dass TTP die mRNAs von IL1α, IL6 und Cxcl2 binden und destabilisieren kann. Zusätzlich zeigen wir, dass die Expression eines Luziferase-Reporters in Anwesenheit von TTP deutlich reduziert wird wenn die Luziferase mRNA an die 3´ UTR von IL1α, IL6, IL12β und Cxcl2 gekoppelt ist.
Einige der identifizierten Ziele von TTP, wie VEGF, COX-2 und IL3, sind essentiell an der Entstehung und dem Fortschreiten von Tumoren beteiligt. In dieser Arbeit beschreiben wir die Rolle von TTP in der Entwicklung von v-abl bedingtem B-Zell Lymphom. Zellen, welche von TTP-/- Mäusen isoliert wurden, zeigen eine erhöhte Tendenz stabile Kolonien zu bilden nachdem das v-abl Onkogen eingebracht wurde. In Versuchen an lebenden Mäusen, welchen transformierte Zellen von Wildtyp und TTP-/- Mäusen injiziert wurden, bilden TTP -/- Zellen signifikant größere Tumore aus, was die Rolle von TTP als Tumor-Unterdrücker weiter untermauert.
Abstract
(Englisch)
Gene expression is regulated at the level of transcription, mRNA stability and translation. The stability of mRNA is in most cases regulated by cis-acting regulatory elements located in the 3´ untranslated regions. The best characterized elements are the so called adenine-uridine-rich sequences (AREs). These AREs are recognized by RNA-binding proteins that may have stabilizing or destabilizing effects. One of these proteins is tristetraprolin (TTP) wich is known to suppress inflammation by accelerating the degradation of cytokine mRNAs. By promoting mRNA decay, TTP significantly contributes to cytokine homeostasis. In this diploma thesis three new TTP targets were characterized. This study shows that TTP can bind and destabilize the mRNA of IL1α, IL6 and Cxcl2 through assays performed with both primary macrophages and through rabbit β-globin reporter assays. Additionally, the presence of TTP significantly reduces the expression of a luciferase gene fused to the 3´ UTR of IL1α, IL6, Cxcl2 and IL12β in reporter assay experiments.
Some of TTPs targets, such as VEGF, COX-2 and IL3, have been shown to play a fundamental role in the formation and progression of various cancers, including colon cancer and mast-cell carcinoma. In this thesis, an involvement of TTP in v-abl induced B-cell lymphoma formation is described. Cells isolated from TTP-deficient mice show an increased ability to form transformed cell lines after transduction with the v-abl oncogene. Subcutaneous injection of v-abl-transformed wild-type and TTP-/- B-cells into recipient mice show an increase in tumor size, further solidifying the hypothesis that TTP acts as a tumor suppressor.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
Tristetraprolin post-transcriptional regulation
Schlagwörter
(Deutsch)
Tristetraprolin Posttranskriptionelle Regulation
Autor*innen
Christian Machacek
Haupttitel (Englisch)
The search for novel mRNAs targeted by the RNA-destabilizing protein tristetraprolin for degradation
Paralleltitel (Deutsch)
Die Suche nach mRNAs wessen Abbau durch das RNA-destabilisierende Protein Tristetraprolin reguliert wird
Publikationsjahr
2010
Umfangsangabe
101 S. : graph. Darst.
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Pavel Kovarik
Klassifikationen
42 Biologie > 42.13 Molekularbiologie ,
42 Biologie > 42.15 Zellbiologie
AC Nummer
AC08257332
Utheses ID
9355
Studienkennzahl
UA | 490 | | |