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A novel approach to identify substrates for the sumoylated Ubc9
Michaela Hubner
Art der Arbeit
Diplomarbeit
Universität
Universität Wien
Fakultät
Zentrum für Molekulare Biologie
Betreuer*in
Andrea Pichler
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-30295.53042.329466-9
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(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Unser Labor konnte zeigen, dass Sumoylierung des E2 konjugierenden Enzyms Ubc9 zur Diskriminierung von SUMO Substraten in Säugetieren beiträgt. Sumoyliertes Ubc9 (S*Ubc9) zeigt keinen Effekt in der Modifikation der meisten SUMO Substrate, aber interessanterweise inhibiert es die Sumoylierung von RanGAP1 und verstärkt signifikant die Sumoylierung des Transkriptionsregulators Sp100 (Knipscheer et al., 2008). Sp100 war allerdings das einzige Substrat zu dieser Zeit, das mit dem sumoylierten Ubc9 verstärkt modifiziert wurde. In dieser Arbeit wurden Protein Microarrays (“ProtoArray® Human Protein Microarray v5.0” von Invitrogen) als neuer Ansatz zur Identifizierung weiterer Substrate für das S*Ubc9 verwendet. Neu identifizierte Substrate wurden in unserem in vitro System verifiziert und werden Einblicke in die biologische Funktion des S*Ubc9 liefern.
Abstract
(Englisch)
Our laboratory has discovered a novel mechanism of how sumoylation of the E2 conjugating enzyme Ubc9 contributes to target discrimination in mammals. Whereas sumoylated Ubc9 (S*Ubc9) does not interfere with the sumoylation of most SUMO substrates, it impairs modification of RanGAP1 and significantly enhances modification of the transcriptional regulator Sp100 (Knipscheer et al., 2008). However, Sp100 was the only substrate so far preferentially targeted by S*Ubc9. In this work, protein microarray chips (“ProtoArray® Human Protein Microarray v5.0”) purchasable from Invitrogen were applied for sumoylation reactions as a novel approach to identify substrates for the S*Ubc9. Newly identified substrates were verified in our in vitro system and will provide novel insights in the biological function of S*Ubc9.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
SUMO E2 conjugating enzyme Ubc9
Schlagwörter
(Deutsch)
SUMO E2 konjugierendes Enzym Ubc9
Autor*innen
Michaela Hubner
Haupttitel (Englisch)
A novel approach to identify substrates for the sumoylated Ubc9
Paralleltitel (Deutsch)
Ein neuer Ansatz zur Identifizierung von Substraten für das sumoylierte Ubc9
Publikationsjahr
2010
Umfangsangabe
65 S.
Sprache
Englisch
Beurteiler*in
Andrea Pichler
Klassifikation
42 Biologie > 42.13 Molekularbiologie
AC Nummer
AC08258350
Utheses ID
9368
Studienkennzahl
UA | 490 | | |