Detailansicht
A genome wide RNAi screen in D. melanogaster for the identification of genes involved in border cell migration
Hannah Neumeier
Art der Arbeit
Dissertation
Universität
Universität Wien
Fakultät
Fakultät für Lebenswissenschaften
Betreuer*in
John Victor Small
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29864.57349.768063-9
Link zu u:search
(Print-Exemplar eventuell in Bibliothek verfügbar)
Abstracts
Abstract
(Deutsch)
Im Verlauf von normalen Entwicklungsprozessen sowie während abnormer Metastasenausbildung weisen Zellen eine bemerkenswerte Umstellung von "unbeweglich" auf "beweglich" auf. Grosses Interesse gilt daher der Erforschung des Expressionsprofils notwendiger Gene während der Zellwanderung selbst. Die Oogenese von der Fruchtfliege Drosophila melanogaster weist programmierte invasive Zellwanderung von sogenannten "Border Cells" auf. Diese spezialisierten Zellen führen einen Übergang von endothelial (stationär) zu mesenchymal (beweglich) durch und wandern zwischen anderen Zellen durch die gesamte Eikammer. Border cell Wanderung ist ein interessantes Modellsystem für in vivo Zellmigration, da viele Parallelen zu sowohl normaler wie auch abnormer Zellmigration vorhanden sind. In Vorversuchen zeige ich, dass durch die RNAi knock down Technik "Border cell" spezifische Gene ausgeschaltet werden können und bereits publizierte Phänotypen reproduziert und phänokopiert werden können. Ich habe die einzigarte RNAi Fliegenbibliothek, (von der Gruppe von Dr. B. Dickson hergestellt) genutzt, um nach Genen zu suchen, die für Zellbewegung speziell während Border Cell Wanderung nötig sind.
Zum ersten Mal in Drosophila Genetik war es möglich, einen systematischen genomweiten RNA interference (RNAi) Screen für Border Cell Wanderung durchzuführen. Im Zuge dieses Screens habe ich 52 neue Gene identifiziert, die bisher noch nicht mit Border Cell Wanderung in Verbindung gebracht worden sind. In der vorliegenden Dissertation präsentiere ich die Realisierung und Durchführung eines genomweiten RNAi Screens, der Border Cell Wanderung während Drosophila Oogenese als Modellsystem verwendet. Darüberhinaus stelle ich ein neu identifiziertes Gen CG34139 vor, das bisher noch nicht charakterisiert wurde und benenne es wanderlust. Wanderlust ist ein Vertreter der Neuroligine und reguliert Border Cell Wanderung.
Abstract
(Englisch)
The transition of a cell from a sessile to a migratory state is a feature shared by normal cells during development and abnormal cells during metastasis. Much interest thus centers on the profile of gene expression required for programmed and uncontrolled cell migration. Border cells in the fruit fly Drosophila melanogaster undergo invasive and programmed cluster migration during oogenesis and represent an attractive model system for the analysis of cell migration in vivo. The goal of this thesis was to identify novel genes required for cell migration in order to better understand migration processes. A comprehensive knowledge of genes crucial for migration could potentially lead to the assignment of drug targets to specifically block deleterious migration such as occurs in metastasis.
I show that RNAi (RNA interference) can be employed to study border cell migration. Background RNAi studies encouraged me to perform a systematic genome wide analysis of border cell migration using the transgenic RNAi collection generated by the group of B.Dickson. The RNAi screen enabled me to identify 52 novel genes, previously not implicated in border cell migration.
Here, I present the realization and description of the first genome wide RNAi screen for genes involved in migration using D. melanogaster border cell migration. Furthermore, I present the initiated characterization of one of the genes identified in the screen, designated as wanderlust, which belongs to the neuroligin familiy of proteins thought to be restricted in expression to neuronal cells, but now identified as a regulator of border cell migration.
Schlagwörter
Schlagwörter
(Englisch)
RNA interference Drosophila melanogaster border cell migration
Schlagwörter
(Deutsch)
RNA Interferenz Drosophila melanogaster Border Zell Wanderung
Autor*innen
Hannah Neumeier
Haupttitel (Englisch)
A genome wide RNAi screen in D. melanogaster for the identification of genes involved in border cell migration
Paralleltitel (Deutsch)
Genom-weite RNA Interferenz Studie in D. melanogaster zur Identifizierung von Border Zell-Wanderungs relevanter Gene
Publikationsjahr
2008
Umfangsangabe
94 S. : Ill., graph. Darst.
Sprache
Englisch
Beurteiler*innen
Barry Dickson ,
Frank Bradke
Klassifikation
30 Naturwissenschaften allgemein > 30.99 Naturwissenschaften allgemein: Sonstiges
AC Nummer
AC05038557
Utheses ID
978
Studienkennzahl
UA | 091 | 490 | |